More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0514 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 
140 aa  287  3e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  90 
 
 
140 aa  261  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  86.43 
 
 
140 aa  256  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  86.43 
 
 
140 aa  256  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  85.71 
 
 
140 aa  254  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  86.43 
 
 
140 aa  248  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  85.71 
 
 
140 aa  246  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  85 
 
 
140 aa  244  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1552  nucleoside diphosphate kinase  82.58 
 
 
132 aa  227  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  75.71 
 
 
140 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 
140 aa  212  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  71.43 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  69.29 
 
 
140 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 
140 aa  207  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  68.57 
 
 
140 aa  207  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 
140 aa  207  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 
140 aa  206  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  69.29 
 
 
140 aa  206  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 
140 aa  205  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  69.29 
 
 
140 aa  205  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  67.86 
 
 
140 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  68.57 
 
 
140 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  68.57 
 
 
140 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  67.86 
 
 
140 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  68.57 
 
 
140 aa  202  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  67.86 
 
 
140 aa  201  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  67.86 
 
 
140 aa  199  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  67.14 
 
 
140 aa  199  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  69.29 
 
 
140 aa  199  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 
139 aa  197  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 
140 aa  197  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  67.14 
 
 
140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 
140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 
143 aa  194  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  67.86 
 
 
140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  65.71 
 
 
140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 
140 aa  194  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 
143 aa  193  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 
140 aa  192  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 
140 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 
140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 
143 aa  187  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 
139 aa  185  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  64.23 
 
 
139 aa  185  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  62.14 
 
 
143 aa  184  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  62.14 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  61.87 
 
 
164 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  60 
 
 
140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 
143 aa  180  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 
143 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 
143 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 
143 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 
143 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0619  nucleoside-diphosphate kinase  58.82 
 
 
141 aa  178  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000154193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  61.43 
 
 
143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 
143 aa  177  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
143 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  60.87 
 
 
141 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
141 aa  176  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
141 aa  176  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  63.04 
 
 
141 aa  176  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 
141 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 
141 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 
139 aa  176  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
141 aa  176  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  60.45 
 
 
141 aa  174  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 
141 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
144 aa  174  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 
141 aa  174  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  58.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  58.7 
 
 
141 aa  174  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 
137 aa  173  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  58.7 
 
 
141 aa  173  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 
141 aa  173  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  60.15 
 
 
142 aa  173  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 
141 aa  173  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 
142 aa  173  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 
141 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
141 aa  172  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
141 aa  173  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
141 aa  172  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
141 aa  172  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
141 aa  172  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
141 aa  172  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
141 aa  172  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
141 aa  172  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  60.9 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  60.14 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  57.97 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  60.15 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.144621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>