More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2433 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 140 aa  283  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  85 
 
 		 140 aa  246  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  78.57 
 
 		 140 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  77.86 
 
 		 140 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  79.29 
 
 		 140 aa  230  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  80 
 
 		 140 aa  229  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  77.14 
 
 		 140 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  77.14 
 
 		 140 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  77.14 
 
 		 140 aa  224  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  72.86 
 
 		 140 aa  213  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 		 140 aa  213  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 		 140 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  75 
 
 		 140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  75 
 
 		 140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  78.57 
 
 		 140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 		 140 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  74.29 
 
 		 140 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  72.86 
 
 		 140 aa  207  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 		 140 aa  206  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  70.29 
 
 		 140 aa  205  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  72.86 
 
 		 140 aa  205  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  72.18 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  68.57 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  67.86 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  70.71 
 
 		 140 aa  204  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  72.86 
 
 		 140 aa  203  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  67.86 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 		 139 aa  200  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  66.43 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  67.86 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  67.14 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  65 
 
 		 140 aa  193  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  66.43 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1552  nucleoside diphosphate kinase  67.42 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  65 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 140 aa  186  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_002978  WD1183  nucleoside diphosphate kinase  61.87 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  60.87 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 139 aa  176  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  61.65 
 
 		 141 aa  173  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  61.48 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  60.15 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  60.9 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  61.65 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  58.7 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0893  nucleoside diphosphate kinase  54.29 
 
 		 145 aa  167  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2872  nucleoside-diphosphate kinase  60.74 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  60.15 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  58.99 
 
 		 164 aa  167  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 		 141 aa  166  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1117  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.357968  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 141 aa  166  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  59.26 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1839  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.587203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6264  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1815  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 137 aa  163  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 		 141 aa  163  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1726  nucleoside diphosphate kinase  58.65 
 
 		 141 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.204847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1753  nucleoside diphosphate kinase  58.65 
 
 		 141 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  57.04 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>