More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2023 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2023  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 		 137 aa  182  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 137 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  57.04 
 
 		 139 aa  167  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  54.74 
 
 		 139 aa  167  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 139 aa  166  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  58.09 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0894  Nucleoside-diphosphate kinase  57.35 
 
 		 139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  58.02 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  52.55 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  53.28 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 159 aa  157  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 137 aa  154  6e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  58.02 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  58.02 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  53.68 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  54.62 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  55.15 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  54.55 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5469  Nucleoside-diphosphate kinase  53.38 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.628942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  52.94 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 142 aa  150  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 		 140 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  54.96 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  55.38 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5149  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  54.96 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  51.47 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  52.94 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  53.44 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  48.89 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  52.31 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  52.31 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0007  nucleoside-diphosphate kinase  54.2 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  51.47 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  51.47 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2872  nucleoside-diphosphate kinase  53.73 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2678  nucleoside diphosphate kinase  53.44 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2784  nucleoside diphosphate kinase  53.44 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2721  nucleoside diphosphate kinase  53.44 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 141 aa  146  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  50.74 
 
 		 143 aa  146  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  52.67 
 
 		 141 aa  147  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2765  nucleoside diphosphate kinase  53.44 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>