More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0787 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 
141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  70.8 
 
 
137 aa  202  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  72.06 
 
 
137 aa  199  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 
141 aa  198  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  68.61 
 
 
137 aa  197  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 
141 aa  198  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 
137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 
137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  68.61 
 
 
143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  70.59 
 
 
137 aa  194  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  69.12 
 
 
141 aa  194  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 
141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  69.34 
 
 
137 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  68.61 
 
 
137 aa  193  5.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 
141 aa  193  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 
141 aa  193  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1478  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 
141 aa  193  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  66.42 
 
 
141 aa  193  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  67.65 
 
 
141 aa  191  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  67.65 
 
 
141 aa  191  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  69.7 
 
 
141 aa  190  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 
137 aa  189  8e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 
143 aa  189  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  67.94 
 
 
141 aa  189  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  63.97 
 
 
142 aa  188  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  67.94 
 
 
141 aa  187  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  68.38 
 
 
141 aa  187  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  66.42 
 
 
143 aa  187  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  66.42 
 
 
143 aa  187  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  64.96 
 
 
142 aa  187  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  64.12 
 
 
141 aa  186  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  67.41 
 
 
146 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  65.44 
 
 
137 aa  185  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  67.18 
 
 
141 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  66.42 
 
 
143 aa  183  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  64.89 
 
 
141 aa  183  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  63.24 
 
 
141 aa  183  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  68.46 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  63.04 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  63.04 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  63.7 
 
 
140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  62.96 
 
 
140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 
141 aa  181  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  64.12 
 
 
141 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  65.65 
 
 
141 aa  181  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  61.76 
 
 
141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 
141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  66.41 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 
143 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  62.5 
 
 
140 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  60.71 
 
 
144 aa  179  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
141 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  63.77 
 
 
140 aa  179  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  62.5 
 
 
140 aa  179  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  64.89 
 
 
141 aa  178  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  62.5 
 
 
139 aa  179  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
141 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
141 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
141 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
141 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
141 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
141 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  62.04 
 
 
140 aa  178  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  63.24 
 
 
147 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 
141 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
141 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 
143 aa  178  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  63.24 
 
 
147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  62.04 
 
 
143 aa  177  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  62.04 
 
 
143 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 
141 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  63.24 
 
 
147 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  61.76 
 
 
141 aa  176  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1839  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 
141 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.587203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6264  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 
141 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1815  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 
141 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 
141 aa  176  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  61.31 
 
 
143 aa  176  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 
141 aa  176  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1726  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 
141 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 
141 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  62.04 
 
 
143 aa  176  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  62.5 
 
 
143 aa  176  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1753  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 
141 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 
143 aa  176  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  62.88 
 
 
141 aa  175  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  63.5 
 
 
140 aa  175  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 
143 aa  175  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  61.76 
 
 
143 aa  174  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1147  nucleoside diphosphate kinase  65.44 
 
 
141 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.662914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1055  nucleoside diphosphate kinase  65.44 
 
 
141 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223396  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  62.04 
 
 
164 aa  174  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  62.04 
 
 
143 aa  174  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>