More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2164 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 139 aa  285  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  70.5 
 
 		 139 aa  218  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  70.5 
 
 		 139 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  64.23 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  62.04 
 
 		 139 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  63.5 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  64.23 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  61.87 
 
 		 139 aa  186  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  63.24 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  63.5 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0894  Nucleoside-diphosphate kinase  62.04 
 
 		 139 aa  179  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  179  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  62.5 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  62.04 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  62.04 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 137 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  60.14 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 137 aa  176  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 137 aa  176  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 141 aa  174  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  54.81 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  58.52 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  54.81 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 137 aa  173  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 141 aa  173  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1552  nucleoside diphosphate kinase  62.12 
 
 		 132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  60.31 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  59.23 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 140 aa  170  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  57.69 
 
 		 141 aa  169  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  56.2 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0387  nucleoside diphosphate kinase  57.04 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  57.04 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  57.69 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  59.23 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  55.88 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 137 aa  167  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  59.23 
 
 		 141 aa  166  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2023  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  54.81 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  56.3 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>