More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1654 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 137 aa  283  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  99.27 
 
 		 137 aa  281  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  83.94 
 
 		 137 aa  240  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  78.83 
 
 		 137 aa  237  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  79.56 
 
 		 137 aa  235  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 		 138 aa  225  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  72.99 
 
 		 137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  64.71 
 
 		 139 aa  193  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 139 aa  183  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0894  Nucleoside-diphosphate kinase  59.56 
 
 		 139 aa  177  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150148  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  59.12 
 
 		 138 aa  177  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  56.62 
 
 		 139 aa  176  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  57.66 
 
 		 138 aa  173  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 140 aa  173  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 		 140 aa  173  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 140 aa  173  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2023  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 140 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  62.22 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  169  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  54.74 
 
 		 139 aa  166  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 140 aa  166  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  55.88 
 
 		 140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  57.89 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0339  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  159  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4382  Nucleoside-diphosphate kinase  55.38 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.46204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4976  nucleoside diphosphate kinase  58.14 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  58.46 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  55.15 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  55.88 
 
 		 137 aa  157  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  55.47 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 		 142 aa  157  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  55.88 
 
 		 137 aa  156  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 141 aa  156  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  55.15 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  56.62 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5469  Nucleoside-diphosphate kinase  57.89 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.628942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  55.88 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0387  nucleoside diphosphate kinase  49.26 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2368  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0653822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6029  Nucleoside-diphosphate kinase  54.89 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.208035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>