More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6029 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6029  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 139 aa  287  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.208035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4382  Nucleoside-diphosphate kinase  81.29 
 
 		 139 aa  239  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.46204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0538  Nucleoside-diphosphate kinase  72.66 
 
 		 139 aa  209  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000118128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3648  nucleoside diphosphate kinase  70.5 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5469  Nucleoside-diphosphate kinase  71.22 
 
 		 139 aa  207  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.628942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4976  nucleoside diphosphate kinase  69.06 
 
 		 139 aa  194  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  66.92 
 
 		 140 aa  185  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0229  nucleoside diphosphate kinase  67.67 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.559671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2236  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0204  nucleoside diphosphate kinase  66.92 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10693  nucleoside diphosphate kinase  64.75 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.371269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0339  nucleoside diphosphate kinase  65.41 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2368  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0653822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2009  nucleoside diphosphate kinase  64.66 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000148983  normal  0.309195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  160  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 140 aa  159  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  54.14 
 
 		 138 aa  159  9e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0474  hypothetical protein  62.4 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 140 aa  156  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 141 aa  156  9e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 137 aa  153  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  153  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 140 aa  153  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  57.14 
 
 		 140 aa  153  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 143 aa  151  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  151  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0894  Nucleoside-diphosphate kinase  53.03 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 137 aa  147  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 137 aa  147  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  146  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 141 aa  147  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 141 aa  147  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  53.24 
 
 		 141 aa  146  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  53.24 
 
 		 141 aa  146  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  146  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  54.89 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 143 aa  143  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  51.82 
 
 		 164 aa  143  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 143 aa  143  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  52.55 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  49.63 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  51.08 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>