More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0339 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0339  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 140 aa  287  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  95.65 
 
 		 140 aa  273  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0229  nucleoside diphosphate kinase  90.71 
 
 		 140 aa  266  8.999999999999999e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.559671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2368  nucleoside diphosphate kinase  90.71 
 
 		 140 aa  265  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0653822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0204  nucleoside diphosphate kinase  88.57 
 
 		 140 aa  258  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2236  nucleoside diphosphate kinase  87.14 
 
 		 141 aa  254  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2009  nucleoside diphosphate kinase  85.71 
 
 		 141 aa  253  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000148983  normal  0.309195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  68.61 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5469  Nucleoside-diphosphate kinase  66.17 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.628942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6029  Nucleoside-diphosphate kinase  65.41 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.208035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10693  nucleoside diphosphate kinase  64.18 
 
 		 161 aa  179  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.371269  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  59.12 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4382  Nucleoside-diphosphate kinase  63.85 
 
 		 139 aa  179  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.46204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0538  Nucleoside-diphosphate kinase  61.65 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000118128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4976  nucleoside diphosphate kinase  61.65 
 
 		 139 aa  170  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  57.04 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  58.78 
 
 		 140 aa  164  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  163  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3648  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 		 139 aa  163  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  58.78 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  161  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  160  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 137 aa  159  8.000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 137 aa  159  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  159  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  58.09 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  157  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 137 aa  156  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  156  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  156  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  54.41 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  53.24 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  56.15 
 
 		 146 aa  151  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  51.47 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 139 aa  150  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  49.28 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 143 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1183  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  50.74 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  53.68 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0894  Nucleoside-diphosphate kinase  48.53 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150148  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>