More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0538 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0538  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 139 aa  283  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000118128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5469  Nucleoside-diphosphate kinase  75.54 
 
 		 139 aa  223  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.628942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6029  Nucleoside-diphosphate kinase  72.66 
 
 		 139 aa  209  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.208035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4976  nucleoside diphosphate kinase  74.1 
 
 		 139 aa  207  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4382  Nucleoside-diphosphate kinase  68.35 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.46204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10693  nucleoside diphosphate kinase  67.63 
 
 		 161 aa  196  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.371269  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3648  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 139 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2236  nucleoside diphosphate kinase  64.66 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0229  nucleoside diphosphate kinase  64.66 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.559671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2368  nucleoside diphosphate kinase  65.41 
 
 		 140 aa  180  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0653822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2009  nucleoside diphosphate kinase  63.16 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000148983  normal  0.309195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  61.94 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0339  nucleoside diphosphate kinase  61.65 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0204  nucleoside diphosphate kinase  61.65 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 159 aa  158  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0474  hypothetical protein  60 
 
 		 130 aa  157  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  57.14 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  56.93 
 
 		 164 aa  156  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 141 aa  156  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 137 aa  154  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 143 aa  153  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  57.89 
 
 		 135 aa  153  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 143 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 143 aa  151  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  55.47 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  54.68 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  52.52 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5149  Nucleoside-diphosphate kinase  51.09 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  56.06 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 141 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 141 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 141 aa  147  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 141 aa  147  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 137 aa  147  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  54.68 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  51.88 
 
 		 138 aa  147  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  48.18 
 
 		 140 aa  147  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 141 aa  146  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  48.18 
 
 		 140 aa  146  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 141 aa  146  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 137 aa  146  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  54.68 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  53.24 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  53.24 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  52.59 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  52.55 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  53.73 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  54.89 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  52.14 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  54.14 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>