More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4976 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4976  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 139 aa  282  9e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10693  nucleoside diphosphate kinase  76.26 
 
 		 161 aa  224  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.371269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5469  Nucleoside-diphosphate kinase  75.54 
 
 		 139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.628942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0538  Nucleoside-diphosphate kinase  74.1 
 
 		 139 aa  207  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000118128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6029  Nucleoside-diphosphate kinase  69.06 
 
 		 139 aa  194  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.208035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4382  Nucleoside-diphosphate kinase  64.75 
 
 		 139 aa  183  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.46204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2236  nucleoside diphosphate kinase  63.91 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3648  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 		 139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2368  nucleoside diphosphate kinase  64.18 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0653822  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0229  nucleoside diphosphate kinase  63.91 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.559671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  61.94 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2009  nucleoside diphosphate kinase  61.65 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000148983  normal  0.309195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0339  nucleoside diphosphate kinase  61.65 
 
 		 140 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0204  nucleoside diphosphate kinase  61.65 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 140 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  58.14 
 
 		 137 aa  159  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  58.14 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0474  hypothetical protein  57.48 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  54.89 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  153  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  58.33 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  56.39 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  56.59 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  58.78 
 
 		 139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  55.22 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  51.91 
 
 		 139 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  149  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  54.01 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  51.88 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5149  Nucleoside-diphosphate kinase  51.82 
 
 		 139 aa  146  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 141 aa  146  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  146  9e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 141 aa  146  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  52.99 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  55.64 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 141 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  55.64 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 141 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  52.71 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 137 aa  143  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 143 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 143 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>