More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3648 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3648  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4382  Nucleoside-diphosphate kinase  71.94 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.46204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6029  Nucleoside-diphosphate kinase  70.5 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.208035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5469  Nucleoside-diphosphate kinase  70.5 
 
 		 139 aa  201  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.628942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0538  Nucleoside-diphosphate kinase  66.91 
 
 		 139 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000118128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10693  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 161 aa  179  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.371269  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4976  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 		 139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2236  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0339  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 		 140 aa  163  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  58.21 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2009  nucleoside diphosphate kinase  58.65 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000148983  normal  0.309195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2368  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0653822  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 139 aa  156  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0229  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.559671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  54.14 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 137 aa  151  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0204  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  52.99 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0474  hypothetical protein  54.69 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2023  nucleoside diphosphate kinase  50.75 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 		 140 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2678  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2765  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 139 aa  141  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2896  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2784  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0894  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150148  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2721  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5149  Nucleoside-diphosphate kinase  48.18 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  52.52 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  51.82 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  51.49 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  51.13 
 
 		 140 aa  137  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  48.18 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  48.12 
 
 		 138 aa  137  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0619  nucleoside-diphosphate kinase  48.15 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000154193  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 143 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20658 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  52.71 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  51.88 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  52.31 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3018  nucleoside diphosphate kinase  54.62 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  51.88 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  46.76 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  46.04 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  50.75 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  49.64 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  54.62 
 
 		 142 aa  133  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  47.37 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>