More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0204 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0204  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 140 aa  286  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0229  nucleoside diphosphate kinase  90 
 
 		 140 aa  264  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.559671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2368  nucleoside diphosphate kinase  87.86 
 
 		 140 aa  258  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0653822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0339  nucleoside diphosphate kinase  88.57 
 
 		 140 aa  258  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  87.14 
 
 		 140 aa  255  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2009  nucleoside diphosphate kinase  85.71 
 
 		 141 aa  251  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000148983  normal  0.309195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2236  nucleoside diphosphate kinase  85 
 
 		 141 aa  247  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  71.53 
 
 		 140 aa  204  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  61.31 
 
 		 138 aa  183  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6029  Nucleoside-diphosphate kinase  66.92 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.208035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4382  Nucleoside-diphosphate kinase  66.15 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.46204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5469  Nucleoside-diphosphate kinase  64.66 
 
 		 139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.628942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10693  nucleoside diphosphate kinase  61.94 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.371269  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0538  Nucleoside-diphosphate kinase  61.65 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000118128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4976  nucleoside diphosphate kinase  61.65 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  55.56 
 
 		 140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  55.56 
 
 		 140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  55.56 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  57.04 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  157  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 143 aa  156  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  153  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  53.68 
 
 		 143 aa  153  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 137 aa  153  8e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  52.94 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1183  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 139 aa  151  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 143 aa  151  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  55.15 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  50.74 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  55.38 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3648  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 139 aa  150  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  49.28 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  54.41 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  49.64 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  52.27 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>