More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3120 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3120  putative type III secretion transmembrane protein, EscU/SctU/YscU-like  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00109617  hitchhiker  0.00266774 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5209  putative type III secretion transmembrane protein, EscU/SctU/YscU-like protein  50 
 
 
246 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266949  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.16 
 
 
356 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  30.49 
 
 
349 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  29.2 
 
 
351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  28.4 
 
 
355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  28.4 
 
 
356 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  28 
 
 
355 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  28.46 
 
 
354 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  29.3 
 
 
352 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  29.3 
 
 
352 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  29.41 
 
 
349 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  29.3 
 
 
352 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  32.41 
 
 
352 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  28.35 
 
 
349 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  32.41 
 
 
352 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  32.41 
 
 
352 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  28.91 
 
 
352 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  29.13 
 
 
352 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  29.44 
 
 
346 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  28.23 
 
 
346 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  27.97 
 
 
373 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3750  type III secretion exporter  30.47 
 
 
343 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  30.77 
 
 
359 aa  96.3  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5440  type III secretion exporter  30.43 
 
 
343 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368429  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3181  FlhB/HrpN/YscU/SpaS family protein  26.91 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  33.59 
 
 
357 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  29.02 
 
 
361 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.42 
 
 
353 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3040  surface presentation of antigens protein SpaS  25.91 
 
 
356 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3197  surface presentation of antigens protein SpaS  25.91 
 
 
356 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.2 
 
 
379 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3092  surface presentation of antigens protein SpaS  25.91 
 
 
356 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000792926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3077  surface presentation of antigens protein SpaS  25.91 
 
 
356 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.24 
 
 
354 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0190  surface presentation of antigens protein SpaS  28.46 
 
 
342 aa  89  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3009  surface presentation of antigens protein SpaS  25 
 
 
356 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.98 
 
 
368 aa  89  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.57 
 
 
363 aa  89  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  26.37 
 
 
369 aa  88.6  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.98 
 
 
362 aa  87.8  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.63 
 
 
357 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.23 
 
 
362 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4741  type III secretion exporter  31.23 
 
 
343 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908956  normal  0.834614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  23.11 
 
 
345 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.59 
 
 
366 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4219  type III secretion exporter  31.23 
 
 
343 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104818  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0054  flagellar biosynthesis protein FlhB  24.89 
 
 
390 aa  86.3  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3522  type III secretion exporter  30.43 
 
 
343 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4844  type III secretion exporter  30.43 
 
 
343 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000249034  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.27 
 
 
357 aa  86.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.51 
 
 
354 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.48 
 
 
358 aa  85.5  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.48 
 
 
363 aa  85.1  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  28.29 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.17 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2261  type III secretion exporter  29.46 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  28.51 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.85 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.14 
 
 
360 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.64 
 
 
373 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.85 
 
 
374 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.98 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  24.9 
 
 
355 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  30 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.52 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0960  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.28 
 
 
384 aa  81.6  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.47 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0043  type III secretion exporter  27.41 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.83 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.83 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.46 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.13 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.41 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.08 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.63 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0164  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.48 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0839  surface presentation of antigens protein SpaS  28.68 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.63 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.49 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  27.82 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2008  type III secretion exporter  25.76 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0213  flagellar biosynthesis protein FlhB  30 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.85 
 
 
406 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  25.79 
 
 
352 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0703  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.5 
 
 
377 aa  79  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246065  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.79 
 
 
353 aa  78.6  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.47 
 
 
377 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  25.79 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.73 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.89 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3287  flagellar biosynthesis protein FlhB  24.18 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.38 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  27.03 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.56 
 
 
383 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.51 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.69 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.05 
 
 
382 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.56 
 
 
383 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  29.05 
 
 
382 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>