268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3971 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3971  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  754    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0790  hypothetical protein  43.55 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0240573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2934  hypothetical protein  44.29 
 
 		 385 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5860  hypothetical protein  34.33 
 
 		 395 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.232479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6011  hypothetical protein  33.7 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7544  hypothetical protein  33.24 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6098  hypothetical protein  33.51 
 
 		 395 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6568  hypothetical protein  33.79 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270027 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5721  hypothetical protein  33.51 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6085  hypothetical protein  33.51 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3646  hypothetical protein  35.05 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5908  hypothetical protein  32.34 
 
 		 390 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1490  hypothetical protein  32.72 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0510  hypothetical protein  33.09 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0476754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3962  hypothetical protein  29.92 
 
 		 274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0275493  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0621  hypothetical protein  33.1 
 
 		 227 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  32.06 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  30.29 
 
 		 819 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.78 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.94 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.13 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1428  hypothetical protein  32.11 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  29.63 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1667 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.49 
 
 		 689 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.4 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.56 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  27.39 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  32.08 
 
 		 1094 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.34 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.78 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.04 
 
 		 821 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  32.79 
 
 		 776 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  25.83 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  32.98 
 
 		 580 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  31.67 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.22 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  35.67 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  32.76 
 
 		 971 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.01 
 
 		 336 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.4 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.48 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.97 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.24 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.95 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.47 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.98 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  30.36 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.32 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.62 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6515  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.81 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.761865  normal  0.0861969 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.56 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.5 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  29.65 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.3 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.91 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.3 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2474  hypothetical protein  24.5 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.686605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.09 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.11 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  28.84 
 
 		 640 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  29.25 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.44 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.25 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.5 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.34 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.94 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.22 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.04 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.94 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.94 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  24.6 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.85 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.6 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.6 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  30.37 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2457  cytochrome d1 heme region  25.42 
 
 		 660 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  30.77 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1196 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  27.42 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.73 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.72 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.79 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.7 
 
 		 457 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.57 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1751  hypothetical protein  24.4 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  27.42 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.26 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.53 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  27.42 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  23.26 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  27.42 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.78 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  27.42 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>