17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0621 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0621  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541106  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7544  hypothetical protein  56.67 
 
 
395 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6011  hypothetical protein  55.33 
 
 
395 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5860  hypothetical protein  56 
 
 
395 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.232479  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6098  hypothetical protein  55.33 
 
 
395 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6568  hypothetical protein  55.33 
 
 
395 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.270027 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5721  hypothetical protein  56 
 
 
395 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6085  hypothetical protein  56 
 
 
395 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1490  hypothetical protein  50 
 
 
400 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0790  hypothetical protein  35.71 
 
 
385 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0240573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3971  hypothetical protein  33.1 
 
 
377 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2934  hypothetical protein  34.29 
 
 
385 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3962  hypothetical protein  30.3 
 
 
274 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0275493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0510  hypothetical protein  29.41 
 
 
381 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0476754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3646  hypothetical protein  25.95 
 
 
398 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5908  hypothetical protein  25 
 
 
390 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.63 
 
 
406 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>