84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1490 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1490  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  803    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6011  hypothetical protein  58.81 
 
 		 395 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6568  hypothetical protein  59.08 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270027 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6085  hypothetical protein  58.81 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6098  hypothetical protein  58.04 
 
 		 395 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5721  hypothetical protein  58.81 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7544  hypothetical protein  58.86 
 
 		 395 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5860  hypothetical protein  57.77 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.232479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3971  hypothetical protein  32.72 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0790  hypothetical protein  34.06 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0240573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2934  hypothetical protein  33.24 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0621  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3646  hypothetical protein  31.9 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5908  hypothetical protein  30.18 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0510  hypothetical protein  30.99 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0476754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3962  hypothetical protein  31.34 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0275493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.7 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.79 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.7 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.04 
 
 		 819 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1667 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.33 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.55 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.86 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  27.27 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  23.81 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  24.7 
 
 		 1094 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  25.73 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1428  hypothetical protein  27.81 
 
 		 250 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.27 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  26.84 
 
 		 776 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.42 
 
 		 335 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.84 
 
 		 607 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  24.8 
 
 		 810 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.49 
 
 		 362 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.81 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0579  hypothetical protein  24.72 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.24 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.51 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.98 
 
 		 821 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  31.25 
 
 		 329 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 517 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.1 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.11 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1170 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.26 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  28.45 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.35 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.26 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.83 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  27.17 
 
 		 971 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.74 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.63 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  28.82 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.83 
 
 		 327 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.82 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.85 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4486  hypothetical protein  24.36 
 
 		 447 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.19 
 
 		 689 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.85 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.12 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.94 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.12 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.12 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.75 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  22.05 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  26.51 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.23 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  20.7 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4517  hypothetical protein  24.73 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  24.31 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.34 
 
 		 312 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5421  WD-40 repeat-containing protein  25.35 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  24.46 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.9 
 
 		 943 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.74 
 
 		 974 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  26.67 
 
 		 487 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.03 
 
 		 320 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.42 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  23.51 
 
 		 445 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23 
 
 		 334 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.15 
 
 		 326 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.93 
 
 		 325 aa  43.1  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>