12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0579 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0579  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  887    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4486  hypothetical protein  30.92 
 
 		 447 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4517  hypothetical protein  31.07 
 
 		 433 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0226  hypothetical protein  26.49 
 
 		 424 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000846841  normal  0.0470571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3646  hypothetical protein  29.75 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5908  hypothetical protein  24.29 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0510  hypothetical protein  29.97 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0476754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3971  hypothetical protein  23.35 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1490  hypothetical protein  24.19 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7544  hypothetical protein  24.27 
 
 		 395 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.72 
 
 		 347 aa  43.5  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6011  hypothetical protein  23.73 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>