55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6568 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5860  hypothetical protein  91.39 
 
 		 395 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.232479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6568  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  789    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270027 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6085  hypothetical protein  98.48 
 
 		 395 aa  778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6098  hypothetical protein  91.39 
 
 		 395 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5721  hypothetical protein  98.48 
 
 		 395 aa  778    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7544  hypothetical protein  94.43 
 
 		 395 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6011  hypothetical protein  89.62 
 
 		 395 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1490  hypothetical protein  56.74 
 
 		 400 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0790  hypothetical protein  36.13 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0240573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3971  hypothetical protein  33.79 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2934  hypothetical protein  32.3 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0621  hypothetical protein  55.33 
 
 		 227 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3646  hypothetical protein  34.8 
 
 		 398 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5908  hypothetical protein  29.7 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3962  hypothetical protein  32.09 
 
 		 274 aa  126  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0275493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0510  hypothetical protein  29.77 
 
 		 381 aa  119  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0476754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1428  hypothetical protein  30.3 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.52 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  24.62 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.14 
 
 		 348 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.71 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.82 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.74 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.41 
 
 		 347 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  24.8 
 
 		 487 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  23.83 
 
 		 819 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.51 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.5 
 
 		 821 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.06 
 
 		 336 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.75 
 
 		 575 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  29.73 
 
 		 329 aa  49.7  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  28.65 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  25.45 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1667 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  23.74 
 
 		 325 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26.16 
 
 		 1094 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.98 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.94 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.38 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  25.91 
 
 		 634 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.59 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  23.57 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.67 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.59 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.07 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  24.55 
 
 		 624 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.21 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.14 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.34 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.01 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  26.38 
 
 		 640 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.32 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  24.73 
 
 		 624 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  24.65 
 
 		 776 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  25.37 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>