18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1428 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1428  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0790  hypothetical protein  36.17 
 
 
385 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0240573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2934  hypothetical protein  36.64 
 
 
385 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3646  hypothetical protein  30.45 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3971  hypothetical protein  32.11 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6011  hypothetical protein  31.66 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5908  hypothetical protein  25.56 
 
 
390 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6085  hypothetical protein  30.61 
 
 
395 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5721  hypothetical protein  30.61 
 
 
395 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6568  hypothetical protein  30.3 
 
 
395 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.270027 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7544  hypothetical protein  29.9 
 
 
395 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6098  hypothetical protein  30.86 
 
 
395 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5860  hypothetical protein  30.86 
 
 
395 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.232479  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3962  hypothetical protein  39.76 
 
 
274 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0275493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0510  hypothetical protein  33.81 
 
 
381 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0476754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1490  hypothetical protein  27.81 
 
 
400 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.47 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.94 
 
 
384 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>