77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6011 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6568  hypothetical protein  89.62 
 
 
395 aa  699    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.270027 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6011  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  783    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5860  hypothetical protein  91.53 
 
 
395 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.232479  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6085  hypothetical protein  90.38 
 
 
395 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6098  hypothetical protein  91.8 
 
 
395 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5721  hypothetical protein  90.38 
 
 
395 aa  703    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7544  hypothetical protein  88.61 
 
 
395 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1490  hypothetical protein  57.14 
 
 
400 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0790  hypothetical protein  36.46 
 
 
385 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0240573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3971  hypothetical protein  33.7 
 
 
377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2934  hypothetical protein  32.47 
 
 
385 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0621  hypothetical protein  55.33 
 
 
227 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541106  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3646  hypothetical protein  34.21 
 
 
398 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5908  hypothetical protein  31.08 
 
 
390 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3962  hypothetical protein  32.46 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0275493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0510  hypothetical protein  31.01 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0476754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1428  hypothetical protein  31.71 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.43 
 
 
517 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.06 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.12 
 
 
366 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.5 
 
 
348 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.19 
 
 
819 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  26.88 
 
 
314 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.91 
 
 
1667 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.76 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.5 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.35 
 
 
821 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.71 
 
 
366 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  27.64 
 
 
487 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  25.37 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.41 
 
 
607 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.77 
 
 
575 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.74 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.16 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.68 
 
 
689 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.9 
 
 
366 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  25.52 
 
 
324 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  27.75 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  26.02 
 
 
324 aa  50.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  27.17 
 
 
1094 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.1 
 
 
329 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.57 
 
 
317 aa  49.7  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  28.89 
 
 
580 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.72 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  25.48 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  28.49 
 
 
634 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 
776 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  29.24 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.17 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.7 
 
 
329 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.35 
 
 
377 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  25.28 
 
 
971 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.49 
 
 
320 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.35 
 
 
340 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.35 
 
 
340 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.35 
 
 
340 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  27.23 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.41 
 
 
366 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  29.81 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  27.03 
 
 
640 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  28.86 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.61 
 
 
660 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  27.44 
 
 
1117 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  25 
 
 
624 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.56 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5386  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.7 
 
 
479 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  26.04 
 
 
810 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.66 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.25 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.6 
 
 
329 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.5 
 
 
328 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  27.07 
 
 
556 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.32 
 
 
326 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.77 
 
 
318 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.85 
 
 
327 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.03 
 
 
335 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.78 
 
 
521 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>