More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3902 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3902  amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
222 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000658211  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3456  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  81.98 
 
 
222 aa  383  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0590  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  75.57 
 
 
223 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1366  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  75.57 
 
 
223 aa  347  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0611  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  75.57 
 
 
223 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0830  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  73.36 
 
 
229 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4071  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  74.78 
 
 
230 aa  342  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2686  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  74.21 
 
 
221 aa  341  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.589624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4022  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  74.21 
 
 
221 aa  341  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000222759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0445  amino acid permease  72.52 
 
 
222 aa  340  9e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1217  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  72.52 
 
 
222 aa  332  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0988  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  69.82 
 
 
222 aa  330  8e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0689  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  59.72 
 
 
238 aa  246  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000168116  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0656  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  59.72 
 
 
238 aa  246  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200234  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0130  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  72.15 
 
 
158 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.082813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3963  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.35 
 
 
230 aa  224  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.54526  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4372  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.44 
 
 
230 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4331  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.87 
 
 
230 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4545  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.35 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.399321  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2257  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.87 
 
 
230 aa  218  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.801291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4537  amino acid ABC transporter permease  54.11 
 
 
223 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194331  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.1 
 
 
230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.153152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3910  amino acid ABC transporter permease  52.17 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.436627  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4173  amino acid ABC transporter, permease protein  51.69 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1098  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.69 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0483  glutamate/aspartate transmembrane ABC transporter protein  52.04 
 
 
227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0359  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.58 
 
 
227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185979  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0374  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.58 
 
 
227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4479  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.87 
 
 
230 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4045  ABC transporter permease  51.21 
 
 
222 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46930  putative permease of ABC transporter  51.21 
 
 
222 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055345 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0401  amino acid ABC transporter permease  53.37 
 
 
227 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1069  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  52.17 
 
 
223 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1110  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.17 
 
 
223 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.66 
 
 
223 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460193  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0459  amino acid ABC transporter permease  53.37 
 
 
227 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07300  amino acid ABC transporter, permease protein  51.83 
 
 
221 aa  198  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2571  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.66 
 
 
225 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  0.0437286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2922  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  50.92 
 
 
224 aa  197  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.742257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3012  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.92 
 
 
224 aa  197  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1838  glutamate/aspartate ABC transporter permease GltK  50.92 
 
 
224 aa  197  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3360  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.66 
 
 
225 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0159961  hitchhiker  0.00000222316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1180  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
225 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0305  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltK  50 
 
 
223 aa  192  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2712  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.94 
 
 
226 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0638  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.46 
 
 
225 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0188  amino acid ABC transporter permease  51.46 
 
 
225 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0671  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.46 
 
 
226 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.432121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3757  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  51.94 
 
 
225 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1227  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein  51.94 
 
 
225 aa  191  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0336  amino acid ABC transporter permease  49.51 
 
 
222 aa  191  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0348  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  51.46 
 
 
225 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.178906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3429  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  51.46 
 
 
225 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2435  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein  51.46 
 
 
225 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3432  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein  51.46 
 
 
225 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00338624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1209  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  51.46 
 
 
225 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2620  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  51.46 
 
 
225 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3394  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  51.46 
 
 
225 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0566  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.97 
 
 
225 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0592  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.97 
 
 
225 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327887  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0599  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter inner membrane protein  51.21 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362285  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2955  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.73 
 
 
224 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0780  glutamate/aspartate ABC transporter permease GltK  49.51 
 
 
224 aa  187  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0767  glutamate/aspartate ABC transporter permease GltK  49.51 
 
 
224 aa  187  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.887715  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0706  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  49.51 
 
 
224 aa  187  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.579306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1212  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.52 
 
 
224 aa  187  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.715432  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0816  glutamate/aspartate ABC transporter permease GltK  49.51 
 
 
224 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00621  glutamate and aspartate transporter subunit  48.1 
 
 
224 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2973  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.1 
 
 
224 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0745  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  48.1 
 
 
224 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2992  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.1 
 
 
224 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0698  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  48.1 
 
 
224 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00611  hypothetical protein  48.1 
 
 
224 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0720  glutamate/aspartate ABC transporter permease protein GltK  49.51 
 
 
224 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1190  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.76 
 
 
224 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0680  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.57 
 
 
224 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3141  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.27 
 
 
224 aa  185  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1101  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.56 
 
 
224 aa  185  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0674  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  47.62 
 
 
224 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.922978  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0681  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  47.62 
 
 
224 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2089  amino acid ABC transporter permease  50 
 
 
230 aa  184  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0596  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltK  47.62 
 
 
224 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1562  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.89 
 
 
225 aa  178  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127302  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 
218 aa  165  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6963  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.63 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1074  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
230 aa  161  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5112  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.01 
 
 
229 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0266858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.42 
 
 
234 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.93 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.78 
 
 
240 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6370  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
252 aa  138  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 
229 aa  138  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0975784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0893  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.84 
 
 
236 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05400  amino acid ABC transporter transmembrane protein  37.32 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.669152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.19 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4076  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.81 
 
 
598 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0310843  hitchhiker  0.00101821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0692  amino acid ABC transporter permease  36.23 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2259  amino acid ABC transporter transmembrane protein  42.93 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2586  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.45 
 
 
256 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>