More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0358 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5854  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.1 
 
 
249 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.49 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.77 
 
 
248 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 
245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  45.27 
 
 
244 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1781  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.02 
 
 
250 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218692  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
251 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
263 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
245 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4910  dehydrogenase  52.59 
 
 
136 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.271824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7533  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  40.46 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.0340576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
261 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  37.11 
 
 
247 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
255 aa  121  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
260 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
252 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.68 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
252 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49109  normal  0.0150297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
267 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.73 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.83 
 
 
247 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.16 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.72 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
249 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
246 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
269 aa  109  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
254 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.16 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0128368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
248 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0207781  normal  0.0184598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
249 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6224  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000552131  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  32 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.98 
 
 
246 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 
254 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  32 
 
 
245 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
241 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.24 
 
 
247 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
247 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
249 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
247 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.25 
 
 
246 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0440497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  32.92 
 
 
245 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
273 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1953  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.58 
 
 
269 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  hitchhiker  0.0000443121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
249 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
249 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
246 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
248 aa  105  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0900  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.71 
 
 
263 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
247 aa  105  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
273 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
273 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
273 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2721  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
249 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
245 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
264 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
249 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
256 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1525  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
266 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191117  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
247 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
273 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
244 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
273 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
254 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
252 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
258 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
279 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229534  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.39 
 
 
246 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
263 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
249 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00209875  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
263 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 
249 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
266 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.752171  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
257 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
251 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
260 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
263 aa  102  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0128625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
249 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
245 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
274 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.768044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
256 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>