More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3963 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  70.23 
 
 		 578 aa  837    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  66.84 
 
 		 572 aa  780    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  63.56 
 
 		 569 aa  730    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  65.98 
 
 		 580 aa  779    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  67.7 
 
 		 583 aa  807    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  65.86 
 
 		 577 aa  776    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  90.86 
 
 		 570 aa  1091    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  66.15 
 
 		 580 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  67.14 
 
 		 579 aa  792    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  65.98 
 
 		 579 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  67.3 
 
 		 578 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  66.67 
 
 		 583 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  66.78 
 
 		 581 aa  815    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  70.49 
 
 		 578 aa  848    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  63.4 
 
 		 580 aa  758    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  66.67 
 
 		 583 aa  791    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 577 aa  1192    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  67.6 
 
 		 586 aa  820    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  66.78 
 
 		 579 aa  790    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  72.59 
 
 		 579 aa  850    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  96.36 
 
 		 577 aa  1157    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  67.59 
 
 		 578 aa  801    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  64.85 
 
 		 569 aa  781    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  59.72 
 
 		 569 aa  670    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  61.36 
 
 		 570 aa  746    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  66.15 
 
 		 581 aa  790    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  67.76 
 
 		 578 aa  804    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  69.67 
 
 		 600 aa  839    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  63.57 
 
 		 571 aa  745    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  67.53 
 
 		 583 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  73.18 
 
 		 578 aa  878    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  67.01 
 
 		 583 aa  801    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  67.24 
 
 		 581 aa  807    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  66.15 
 
 		 577 aa  783    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  65.1 
 
 		 577 aa  781    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  65.1 
 
 		 577 aa  781    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  65.52 
 
 		 580 aa  785    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  67.01 
 
 		 583 aa  801    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  62.46 
 
 		 568 aa  754    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  56.69 
 
 		 579 aa  666    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  67.53 
 
 		 583 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  68.58 
 
 		 578 aa  799    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  58.58 
 
 		 575 aa  638    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  65.1 
 
 		 586 aa  782    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  65.15 
 
 		 578 aa  756    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  68.06 
 
 		 577 aa  808    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  66.9 
 
 		 582 aa  779    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  67.01 
 
 		 583 aa  800    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  63.65 
 
 		 574 aa  741    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  64.93 
 
 		 577 aa  771    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  68.88 
 
 		 577 aa  803    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  64.88 
 
 		 579 aa  780    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  66.73 
 
 		 569 aa  776    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  68.06 
 
 		 577 aa  793    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  66.61 
 
 		 583 aa  794    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  52.47 
 
 		 586 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4283  dihydroxy-acid dehydratase  52.26 
 
 		 601 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0518  dihydroxy-acid dehydratase  52.76 
 
 		 573 aa  595  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000961821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4447  Dihydroxy-acid dehydratase  53.19 
 
 		 580 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4217  dihydroxy-acid dehydratase  53.48 
 
 		 580 aa  594  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298281  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0539  dihydroxy-acid dehydratase  51.05 
 
 		 578 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0143  Dihydroxy-acid dehydratase  52.37 
 
 		 586 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5385  dihydroxy-acid dehydratase  51.16 
 
 		 582 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585495  normal  0.849762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2297  dihydroxy-acid dehydratase  48.95 
 
 		 579 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0371112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3320  dihydroxy-acid dehydratase  50.61 
 
 		 574 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5271  dihydroxy-acid dehydratase  47.71 
 
 		 594 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1698  dihydroxy-acid dehydratase  48.26 
 
 		 579 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6247  dihydroxy-acid dehydratase  48.94 
 
 		 577 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.600681 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5349  dihydroxy-acid dehydratase  48.17 
 
 		 578 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.7217 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5697  dihydroxy-acid dehydratase  50.52 
 
 		 587 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3404  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 576 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2821  dihydroxy-acid dehydratase  48.67 
 
 		 576 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5711  dihydroxy-acid dehydratase  48.59 
 
 		 575 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0870654  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5407  dihydroxy-acid dehydratase  47.64 
 
 		 578 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205419  decreased coverage  0.00130415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2210  dihydroxy-acid dehydratase  49.56 
 
 		 576 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703379  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2121  dihydroxy-acid dehydratase  46.96 
 
 		 576 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40195  normal  0.0621198 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4022  dihydroxy-acid dehydratase  48.67 
 
 		 573 aa  548  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3912  dihydroxy-acid dehydratase  47.73 
 
 		 575 aa  542  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000220619  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5057  dihydroxy-acid dehydratase  49.29 
 
 		 578 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3343  dihydroxy-acid dehydratase  48.52 
 
 		 577 aa  541  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4465  dihydroxy-acid dehydratase  48.13 
 
 		 580 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.98361  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1958  Dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 		 574 aa  529  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0224765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3759  dihydroxyacid dehydratase  48.51 
 
 		 591 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0037  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 629 aa  521  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0882  dihydroxy-acid dehydratase  50.83 
 
 		 601 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0940  dihydroxy-acid dehydratase  50.83 
 
 		 601 aa  514  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234508  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6261  dihydroxy-acid dehydratase  48.06 
 
 		 584 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1421  dihydroxy-acid dehydratase  47.8 
 
 		 601 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8653  dihydroxy-acid and 6-phosphogluconate dehydratase  71.6 
 
 		 386 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3950  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 587 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5831  dihydroxy-acid dehydratase  48.99 
 
 		 590 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0433  dihydroxy-acid dehydratase  45.76 
 
 		 586 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3810  dihydroxy-acid dehydratase  47.55 
 
 		 584 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0884  dihydroxy-acid dehydratase  47.34 
 
 		 582 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00253808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3116  dihydroxy-acid dehydratase  45.39 
 
 		 595 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3694  dihydroxy-acid dehydratase  46.72 
 
 		 598 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3648  dihydroxy-acid dehydratase  46.82 
 
 		 599 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.458648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3551  dihydroxy-acid dehydratase  45.74 
 
 		 607 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1467  dihydroxy-acid dehydratase  46.48 
 
 		 593 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.454096  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3955  dihydroxy-acid dehydratase  44.97 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>