More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4589 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  56.08 
 
 
570 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
579 aa  1173    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  56.69 
 
 
577 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  56.16 
 
 
577 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  56.29 
 
 
578 aa  645    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  55.4 
 
 
578 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  55.69 
 
 
578 aa  642    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  55.15 
 
 
577 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  54.59 
 
 
581 aa  632  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  54.14 
 
 
586 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  54.96 
 
 
578 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  54.18 
 
 
581 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  55.11 
 
 
600 aa  631  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  54.09 
 
 
568 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  53.59 
 
 
581 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  53.99 
 
 
580 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  53.79 
 
 
583 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  54.28 
 
 
583 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  54.04 
 
 
583 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  54.21 
 
 
578 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  53.99 
 
 
580 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  54.48 
 
 
583 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  53.39 
 
 
579 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  53.94 
 
 
579 aa  620  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  54.43 
 
 
578 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  53.7 
 
 
583 aa  618  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  52.38 
 
 
572 aa  616  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  53.18 
 
 
583 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  54.37 
 
 
578 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  53.53 
 
 
583 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  53.18 
 
 
583 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  53.53 
 
 
583 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  53.02 
 
 
578 aa  616  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  52.41 
 
 
569 aa  614  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  53.12 
 
 
580 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  53.4 
 
 
577 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  53.15 
 
 
586 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  53.81 
 
 
582 aa  614  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 
577 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  52.64 
 
 
574 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  53.12 
 
 
577 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  53.17 
 
 
577 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  53.15 
 
 
577 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  53.15 
 
 
577 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  52.7 
 
 
579 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  53.75 
 
 
577 aa  611  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  52.48 
 
 
579 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  52.85 
 
 
579 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  52.5 
 
 
570 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  51.06 
 
 
580 aa  599  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  51.33 
 
 
571 aa  597  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  51.96 
 
 
569 aa  596  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  51.6 
 
 
569 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  52.13 
 
 
569 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  49.3 
 
 
586 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0518  dihydroxy-acid dehydratase  46.36 
 
 
573 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000961821  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4447  Dihydroxy-acid dehydratase  48.33 
 
 
580 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0143  Dihydroxy-acid dehydratase  48.68 
 
 
586 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4283  dihydroxy-acid dehydratase  47.74 
 
 
601 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  50.7 
 
 
575 aa  534  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0539  dihydroxy-acid dehydratase  46.63 
 
 
578 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2297  dihydroxy-acid dehydratase  47.4 
 
 
579 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0371112  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1958  Dihydroxy-acid dehydratase  47.65 
 
 
574 aa  522  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0224765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1698  dihydroxy-acid dehydratase  46.86 
 
 
579 aa  521  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471971  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2210  dihydroxy-acid dehydratase  48.05 
 
 
576 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3404  dihydroxy-acid dehydratase  47.34 
 
 
576 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2121  dihydroxy-acid dehydratase  46.25 
 
 
576 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40195  normal  0.0621198 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5407  dihydroxy-acid dehydratase  45.66 
 
 
578 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205419  decreased coverage  0.00130415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5271  dihydroxy-acid dehydratase  44.87 
 
 
594 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3343  dihydroxy-acid dehydratase  46.37 
 
 
577 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5711  dihydroxy-acid dehydratase  45.04 
 
 
575 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0870654  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5349  dihydroxy-acid dehydratase  46.02 
 
 
578 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.7217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3912  dihydroxy-acid dehydratase  45.88 
 
 
575 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000220619  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4217  dihydroxy-acid dehydratase  47.15 
 
 
580 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298281  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2821  dihydroxy-acid dehydratase  45.41 
 
 
576 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5385  dihydroxy-acid dehydratase  46.15 
 
 
582 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585495  normal  0.849762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3320  dihydroxy-acid dehydratase  46.54 
 
 
574 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195004  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5057  dihydroxy-acid dehydratase  47.3 
 
 
578 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5697  dihydroxy-acid dehydratase  46.43 
 
 
587 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4022  dihydroxy-acid dehydratase  46.31 
 
 
573 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6247  dihydroxy-acid dehydratase  44.4 
 
 
577 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.600681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3759  dihydroxyacid dehydratase  45.44 
 
 
591 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4465  dihydroxy-acid dehydratase  45.49 
 
 
580 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.98361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0433  dihydroxy-acid dehydratase  44.96 
 
 
586 aa  480  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2834  dihydroxy-acid dehydratase  45.22 
 
 
568 aa  475  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3191  dihydroxy-acid dehydratase  46.36 
 
 
566 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0884  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 
582 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00253808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3810  dihydroxy-acid dehydratase  46.93 
 
 
584 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0037  dihydroxy-acid dehydratase  45.2 
 
 
629 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5831  dihydroxy-acid dehydratase  46.27 
 
 
590 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6261  dihydroxy-acid dehydratase  46.27 
 
 
584 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2216  dihydroxy-acid dehydratase  45.54 
 
 
569 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3950  dihydroxy-acid dehydratase  44.72 
 
 
587 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2448  dihydroxy-acid dehydratase  45.27 
 
 
568 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2470  dihydroxy-acid dehydratase  45.24 
 
 
567 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3247  dihydroxy-acid dehydratase  45.37 
 
 
569 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.652611  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3757  dihydroxy-acid dehydratase  44.75 
 
 
570 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0453  dihydroxy-acid dehydratase  44.51 
 
 
571 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1318  dihydroxy-acid dehydratase  43.66 
 
 
575 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3955  dihydroxy-acid dehydratase  41.68 
 
 
570 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>