More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3551 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07358  hypothetical dihydroxy-acid dehydratase (Eurofung)  63.58 
 
 		 651 aa  796    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2875  dihydroxy-acid dehydratase  75.93 
 
 		 599 aa  934    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284792  normal  0.328193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6403  dihydroxy-acid dehydratase  66.72 
 
 		 595 aa  843    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1326  dihydroxy-acid dehydratase  72.47 
 
 		 599 aa  876    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214365  normal  0.115869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1998  dihydroxy-acid dehydratase  76.95 
 
 		 604 aa  956    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4003  dihydroxy-acid dehydratase  63.59 
 
 		 597 aa  802    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0940  dihydroxy-acid dehydratase  73.57 
 
 		 601 aa  922    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234508  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1467  dihydroxy-acid dehydratase  67.52 
 
 		 593 aa  807    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.454096  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1810  dihydroxy-acid dehydratase  66.44 
 
 		 593 aa  800    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04770  dihydroxy-acid dehydratase, putative  62.44 
 
 		 636 aa  761    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3093  dihydroxy-acid dehydratase  64.53 
 
 		 594 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0227397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3613  dihydroxy-acid dehydratase  72.3 
 
 		 600 aa  882    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3116  dihydroxy-acid dehydratase  66.61 
 
 		 595 aa  825    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0176  dihydroxy-acid dehydratase  66.61 
 
 		 593 aa  803    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0882  dihydroxy-acid dehydratase  73.74 
 
 		 601 aa  924    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0087  dihydroxy-acid dehydratase  70.61 
 
 		 593 aa  858    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2457  dihydroxy-acid dehydratase  64.53 
 
 		 593 aa  781    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000103031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2095  dihydroxy-acid dehydratase  86.82 
 
 		 602 aa  1083    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2904  dihydroxy-acid dehydratase  72.37 
 
 		 601 aa  850    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0987  dihydroxy-acid dehydratase  65.71 
 
 		 617 aa  786    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.076567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0861  dihydroxy-acid dehydratase  64.81 
 
 		 594 aa  805    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3648  dihydroxy-acid dehydratase  87.35 
 
 		 599 aa  1083    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.458648 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1359  dihydroxy-acid dehydratase  66.61 
 
 		 594 aa  846    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188319  normal  0.638946 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4082  dihydroxy-acid dehydratase  66.78 
 
 		 594 aa  809    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3324  dihydroxy-acid dehydratase  87.84 
 
 		 602 aa  1092    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1145  dihydroxy-acid dehydratase  68.38 
 
 		 600 aa  848    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4194  dihydroxy-acid dehydratase  66.78 
 
 		 594 aa  809    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6461  dihydroxy-acid dehydratase  66.22 
 
 		 593 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4584  dihydroxy-acid dehydratase  66.89 
 
 		 593 aa  801    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4493  dihydroxy-acid dehydratase  63.51 
 
 		 586 aa  763    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3694  dihydroxy-acid dehydratase  67.45 
 
 		 598 aa  847    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3617  dihydroxy-acid dehydratase  68.41 
 
 		 599 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.886843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2488  dihydroxy-acid dehydratase  64.88 
 
 		 592 aa  787    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1675  dihydroxy-acid dehydratase  73.94 
 
 		 603 aa  904    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.75973  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6168  dihydroxy-acid dehydratase  67.23 
 
 		 598 aa  833    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.017336 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6696  dihydroxy-acid dehydratase  66.22 
 
 		 593 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6298  dihydroxy-acid dehydratase  66.05 
 
 		 593 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4905  dihydroxy-acid dehydratase  73.6 
 
 		 603 aa  897    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.751996  hitchhiker  0.00289636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3551  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 607 aa  1253    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3962  dihydroxy-acid dehydratase  87.67 
 
 		 602 aa  1096    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0754  dihydroxy-acid dehydratase  64.14 
 
 		 593 aa  772    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3350  dihydroxy-acid dehydratase  65.2 
 
 		 594 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.907345  hitchhiker  0.00746579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1421  dihydroxy-acid dehydratase  73.91 
 
 		 601 aa  920    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0940  dihydroxy-acid dehydratase  65.76 
 
 		 592 aa  800    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  46.53 
 
 		 577 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  46.32 
 
 		 577 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  45.74 
 
 		 577 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  46.81 
 
 		 579 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  45.86 
 
 		 570 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  45.74 
 
 		 586 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  46.23 
 
 		 578 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  45.57 
 
 		 581 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  46.1 
 
 		 581 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  45.8 
 
 		 577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  45.57 
 
 		 582 aa  472  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  45.74 
 
 		 580 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 		 577 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 		 577 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  45.62 
 
 		 579 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  46.18 
 
 		 586 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  44 
 
 		 579 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  44.78 
 
 		 583 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  45.56 
 
 		 569 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  44.26 
 
 		 578 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  45.1 
 
 		 577 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  45.24 
 
 		 578 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  44.22 
 
 		 580 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  45.08 
 
 		 578 aa  459  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  44.09 
 
 		 580 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  44.09 
 
 		 580 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  44.39 
 
 		 583 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  44.15 
 
 		 581 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  44.67 
 
 		 577 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  44.71 
 
 		 583 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  44.22 
 
 		 583 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  44.71 
 
 		 583 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  44.22 
 
 		 583 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  44.17 
 
 		 579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  43.89 
 
 		 583 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  44.11 
 
 		 577 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  43.89 
 
 		 583 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  44.46 
 
 		 583 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  44.13 
 
 		 578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  43.03 
 
 		 578 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  44.5 
 
 		 578 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  45.23 
 
 		 577 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  42.95 
 
 		 600 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  44.21 
 
 		 574 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  43.52 
 
 		 568 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  44.55 
 
 		 572 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  43.05 
 
 		 579 aa  428  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  42.16 
 
 		 570 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  42.45 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  43.28 
 
 		 569 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  42.93 
 
 		 571 aa  411  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  41.57 
 
 		 569 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  42.29 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  40.76 
 
 		 586 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  39.93 
 
 		 579 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  41.32 
 
 		 575 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>