More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3648 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0087  dihydroxy-acid dehydratase  68.86 
 
 		 593 aa  840    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07358  hypothetical dihydroxy-acid dehydratase (Eurofung)  63.91 
 
 		 651 aa  791    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0861  dihydroxy-acid dehydratase  64.81 
 
 		 594 aa  802    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159597 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0940  dihydroxy-acid dehydratase  73.54 
 
 		 601 aa  919    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3551  dihydroxy-acid dehydratase  87.35 
 
 		 607 aa  1083    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0882  dihydroxy-acid dehydratase  73.88 
 
 		 601 aa  924    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1467  dihydroxy-acid dehydratase  66.95 
 
 		 593 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.454096  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04770  dihydroxy-acid dehydratase, putative  62.67 
 
 		 636 aa  743    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1421  dihydroxy-acid dehydratase  73.88 
 
 		 601 aa  922    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0176  dihydroxy-acid dehydratase  67.05 
 
 		 593 aa  811    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3093  dihydroxy-acid dehydratase  63.88 
 
 		 594 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0227397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4584  dihydroxy-acid dehydratase  67.06 
 
 		 593 aa  807    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4003  dihydroxy-acid dehydratase  63.68 
 
 		 597 aa  786    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6403  dihydroxy-acid dehydratase  66.44 
 
 		 595 aa  834    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2095  dihydroxy-acid dehydratase  91.89 
 
 		 602 aa  1137    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682042 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3694  dihydroxy-acid dehydratase  67.45 
 
 		 598 aa  844    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1326  dihydroxy-acid dehydratase  69.9 
 
 		 599 aa  847    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214365  normal  0.115869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0987  dihydroxy-acid dehydratase  64.61 
 
 		 617 aa  775    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.076567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3648  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 599 aa  1234    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.458648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2904  dihydroxy-acid dehydratase  70.59 
 
 		 601 aa  822    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1359  dihydroxy-acid dehydratase  66.84 
 
 		 594 aa  842    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188319  normal  0.638946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3324  dihydroxy-acid dehydratase  92.4 
 
 		 602 aa  1139    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1145  dihydroxy-acid dehydratase  66.94 
 
 		 600 aa  840    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3613  dihydroxy-acid dehydratase  70.76 
 
 		 600 aa  867    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4905  dihydroxy-acid dehydratase  72.93 
 
 		 603 aa  877    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.751996  hitchhiker  0.00289636 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6461  dihydroxy-acid dehydratase  67.17 
 
 		 593 aa  834    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3116  dihydroxy-acid dehydratase  66.61 
 
 		 595 aa  819    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4493  dihydroxy-acid dehydratase  64.19 
 
 		 586 aa  761    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2875  dihydroxy-acid dehydratase  75.13 
 
 		 599 aa  916    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284792  normal  0.328193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2457  dihydroxy-acid dehydratase  63.94 
 
 		 593 aa  764    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000103031 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6298  dihydroxy-acid dehydratase  67 
 
 		 593 aa  832    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1675  dihydroxy-acid dehydratase  73.1 
 
 		 603 aa  878    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.75973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2488  dihydroxy-acid dehydratase  64.86 
 
 		 592 aa  783    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1998  dihydroxy-acid dehydratase  78.08 
 
 		 604 aa  950    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6696  dihydroxy-acid dehydratase  67.17 
 
 		 593 aa  834    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3962  dihydroxy-acid dehydratase  88.51 
 
 		 602 aa  1102    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3617  dihydroxy-acid dehydratase  66.95 
 
 		 599 aa  788    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.886843 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6168  dihydroxy-acid dehydratase  66.05 
 
 		 598 aa  818    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.017336 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1810  dihydroxy-acid dehydratase  66.89 
 
 		 593 aa  807    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0754  dihydroxy-acid dehydratase  64.6 
 
 		 593 aa  766    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4194  dihydroxy-acid dehydratase  67.4 
 
 		 594 aa  806    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4082  dihydroxy-acid dehydratase  67.4 
 
 		 594 aa  806    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3350  dihydroxy-acid dehydratase  65.54 
 
 		 594 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.907345  hitchhiker  0.00746579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0940  dihydroxy-acid dehydratase  65.54 
 
 		 592 aa  782    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  47.65 
 
 		 570 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  48.44 
 
 		 586 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 577 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  47.82 
 
 		 579 aa  487  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  46.99 
 
 		 577 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 		 578 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  49.36 
 
 		 581 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  46.82 
 
 		 577 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  46.72 
 
 		 581 aa  475  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  46.11 
 
 		 569 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  48.71 
 
 		 578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  46.18 
 
 		 577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  47.79 
 
 		 577 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  47.79 
 
 		 577 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  45.5 
 
 		 579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  47.24 
 
 		 577 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  45.88 
 
 		 580 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  45.33 
 
 		 579 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  47.42 
 
 		 586 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  45.58 
 
 		 582 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  45.12 
 
 		 583 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  45.9 
 
 		 581 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  47.24 
 
 		 580 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  47.24 
 
 		 580 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  45.53 
 
 		 577 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  45.73 
 
 		 578 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  45.73 
 
 		 578 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  44.85 
 
 		 578 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  44.54 
 
 		 580 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  46.69 
 
 		 583 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  44.09 
 
 		 579 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  45.34 
 
 		 583 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  46.69 
 
 		 583 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  46.51 
 
 		 583 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  46.69 
 
 		 583 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  46.51 
 
 		 583 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  46.48 
 
 		 577 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  43.02 
 
 		 578 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  46.32 
 
 		 583 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  44.72 
 
 		 583 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  45.37 
 
 		 568 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  43.7 
 
 		 600 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  44.01 
 
 		 578 aa  438  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  45.26 
 
 		 577 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  45.29 
 
 		 570 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  44.73 
 
 		 572 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  44.44 
 
 		 569 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  43.94 
 
 		 579 aa  428  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  43.57 
 
 		 574 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  42.68 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  45.64 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  45.08 
 
 		 571 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  41.65 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  44.77 
 
 		 578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  43.18 
 
 		 575 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4217  dihydroxy-acid dehydratase  39.59 
 
 		 580 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298281  normal  0.960065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>