More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8653 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8653  dihydroxy-acid and 6-phosphogluconate dehydratase  100 
 
 		 386 aa  785    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  89.85 
 
 		 578 aa  618  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  89.88 
 
 		 600 aa  618  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  88.46 
 
 		 578 aa  611  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  73.17 
 
 		 579 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  71.6 
 
 		 577 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  73.17 
 
 		 578 aa  504  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  72.16 
 
 		 570 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  71.43 
 
 		 577 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  63.23 
 
 		 579 aa  474  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  67.74 
 
 		 578 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  63.59 
 
 		 577 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  68.14 
 
 		 578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  68.44 
 
 		 583 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  67.07 
 
 		 581 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  68.14 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  68.44 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  67.35 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  68.14 
 
 		 583 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  68.44 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  68.24 
 
 		 577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  62.8 
 
 		 579 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  68.44 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  68.14 
 
 		 583 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  67.55 
 
 		 578 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  68.44 
 
 		 583 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  62.7 
 
 		 577 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  67.95 
 
 		 580 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  67.77 
 
 		 581 aa  468  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  67.55 
 
 		 578 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  66.37 
 
 		 580 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  66.37 
 
 		 580 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  63.72 
 
 		 586 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  66.17 
 
 		 582 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  66.86 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  64.29 
 
 		 579 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  64.88 
 
 		 581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  64.82 
 
 		 569 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  63.99 
 
 		 579 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  64.5 
 
 		 580 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  61.2 
 
 		 574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  63.16 
 
 		 577 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  62.87 
 
 		 577 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  60.71 
 
 		 572 aa  441  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  61.07 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  63.69 
 
 		 577 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  63.69 
 
 		 577 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  63.39 
 
 		 586 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  65.64 
 
 		 578 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  60.59 
 
 		 569 aa  435  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  60.78 
 
 		 569 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  58.67 
 
 		 570 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  60.74 
 
 		 568 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  54.36 
 
 		 579 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  53.35 
 
 		 569 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4217  dihydroxy-acid dehydratase  48.7 
 
 		 580 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298281  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  56.23 
 
 		 575 aa  354  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  47.37 
 
 		 586 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5697  dihydroxy-acid dehydratase  49 
 
 		 587 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0143  Dihydroxy-acid dehydratase  49.35 
 
 		 586 aa  345  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3320  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 		 574 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4283  dihydroxy-acid dehydratase  47.14 
 
 		 601 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0539  dihydroxy-acid dehydratase  45.55 
 
 		 578 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4447  Dihydroxy-acid dehydratase  53.37 
 
 		 580 aa  340  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5385  dihydroxy-acid dehydratase  47.34 
 
 		 582 aa  338  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585495  normal  0.849762 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0518  dihydroxy-acid dehydratase  48.09 
 
 		 573 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000961821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1958  Dihydroxy-acid dehydratase  52.45 
 
 		 574 aa  332  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0224765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2121  dihydroxy-acid dehydratase  44.79 
 
 		 576 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40195  normal  0.0621198 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5349  dihydroxy-acid dehydratase  43.81 
 
 		 578 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.7217 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6247  dihydroxy-acid dehydratase  45.93 
 
 		 577 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.600681 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5407  dihydroxy-acid dehydratase  44.5 
 
 		 578 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205419  decreased coverage  0.00130415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5271  dihydroxy-acid dehydratase  45.43 
 
 		 594 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2821  dihydroxy-acid dehydratase  44.56 
 
 		 576 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3343  dihydroxy-acid dehydratase  46.38 
 
 		 577 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2210  dihydroxy-acid dehydratase  47.63 
 
 		 576 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3404  dihydroxy-acid dehydratase  45.45 
 
 		 576 aa  322  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4022  dihydroxy-acid dehydratase  46.58 
 
 		 573 aa  322  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3912  dihydroxy-acid dehydratase  44.03 
 
 		 575 aa  318  9e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000220619  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5711  dihydroxy-acid dehydratase  45.24 
 
 		 575 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0870654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2297  dihydroxy-acid dehydratase  44.76 
 
 		 579 aa  316  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0371112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1698  dihydroxy-acid dehydratase  47.94 
 
 		 579 aa  315  8e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3694  dihydroxy-acid dehydratase  49.42 
 
 		 598 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5057  dihydroxy-acid dehydratase  46.34 
 
 		 578 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6461  dihydroxy-acid dehydratase  47.59 
 
 		 593 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6696  dihydroxy-acid dehydratase  47.59 
 
 		 593 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1421  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 601 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0882  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 601 aa  309  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0940  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 601 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3116  dihydroxy-acid dehydratase  48.4 
 
 		 595 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6298  dihydroxy-acid dehydratase  47.33 
 
 		 593 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3759  dihydroxyacid dehydratase  45.21 
 
 		 591 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4194  dihydroxy-acid dehydratase  48.56 
 
 		 594 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4082  dihydroxy-acid dehydratase  48.56 
 
 		 594 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0087  dihydroxy-acid dehydratase  48.22 
 
 		 593 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1998  dihydroxy-acid dehydratase  48.96 
 
 		 604 aa  305  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4465  dihydroxy-acid dehydratase  46.68 
 
 		 580 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.98361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4584  dihydroxy-acid dehydratase  48.38 
 
 		 593 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1359  dihydroxy-acid dehydratase  48.5 
 
 		 594 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188319  normal  0.638946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0176  dihydroxy-acid dehydratase  50.15 
 
 		 593 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1326  dihydroxy-acid dehydratase  48.39 
 
 		 599 aa  299  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214365  normal  0.115869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>