More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0434 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  60.25 
 
 		 579 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  70.3 
 
 		 578 aa  819    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  63.15 
 
 		 578 aa  717    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  63.26 
 
 		 580 aa  725    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  59.08 
 
 		 568 aa  704    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  62.7 
 
 		 578 aa  727    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  63.43 
 
 		 580 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  62.24 
 
 		 580 aa  727    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  63.6 
 
 		 577 aa  726    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  64.36 
 
 		 578 aa  734    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  64.75 
 
 		 581 aa  746    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  61.75 
 
 		 583 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  61.59 
 
 		 578 aa  721    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 574 aa  1176    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  63.26 
 
 		 577 aa  730    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  61.75 
 
 		 583 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  59.44 
 
 		 572 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  62.78 
 
 		 583 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  62.74 
 
 		 583 aa  713    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  63.24 
 
 		 579 aa  715    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  63.92 
 
 		 579 aa  735    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  63.48 
 
 		 577 aa  737    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  58.35 
 
 		 569 aa  688    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  63.56 
 
 		 578 aa  716    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  62.99 
 
 		 581 aa  729    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  63.32 
 
 		 578 aa  720    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  62.26 
 
 		 583 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  61.82 
 
 		 578 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  63.65 
 
 		 577 aa  741    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  75.61 
 
 		 571 aa  887    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  61.58 
 
 		 583 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  61.27 
 
 		 570 aa  707    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  60.42 
 
 		 581 aa  710    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  64.13 
 
 		 569 aa  719    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  63.05 
 
 		 600 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  61.25 
 
 		 577 aa  697    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  61.25 
 
 		 577 aa  697    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  61.75 
 
 		 583 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  61.58 
 
 		 583 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  61.58 
 
 		 583 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  59.23 
 
 		 586 aa  705    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  61.25 
 
 		 586 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  75.27 
 
 		 569 aa  877    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  61.12 
 
 		 582 aa  701    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  60.69 
 
 		 577 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  60.07 
 
 		 579 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  63.26 
 
 		 577 aa  714    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  64.06 
 
 		 579 aa  729    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  60.93 
 
 		 580 aa  699    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  61.94 
 
 		 577 aa  705    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  62.74 
 
 		 577 aa  705    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  63.57 
 
 		 570 aa  733    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  57.42 
 
 		 569 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  52.64 
 
 		 579 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0518  dihydroxy-acid dehydratase  51.15 
 
 		 573 aa  601  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000961821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  56.25 
 
 		 575 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4283  dihydroxy-acid dehydratase  51.61 
 
 		 601 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4217  dihydroxy-acid dehydratase  50.43 
 
 		 580 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298281  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  51.15 
 
 		 586 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4447  Dihydroxy-acid dehydratase  52.51 
 
 		 580 aa  590  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5385  dihydroxy-acid dehydratase  50.8 
 
 		 582 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585495  normal  0.849762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3320  dihydroxy-acid dehydratase  51.15 
 
 		 574 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0143  Dihydroxy-acid dehydratase  53.18 
 
 		 586 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4022  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 573 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2121  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 576 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40195  normal  0.0621198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0539  dihydroxy-acid dehydratase  49.65 
 
 		 578 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1958  Dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 		 574 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0224765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2297  dihydroxy-acid dehydratase  50.26 
 
 		 579 aa  568  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0371112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5271  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 594 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3343  dihydroxy-acid dehydratase  50.35 
 
 		 577 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2210  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 		 576 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703379  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5349  dihydroxy-acid dehydratase  48.14 
 
 		 578 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.7217 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5711  dihydroxy-acid dehydratase  49.3 
 
 		 575 aa  558  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0870654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3404  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 576 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5057  dihydroxy-acid dehydratase  50.52 
 
 		 578 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6247  dihydroxy-acid dehydratase  48.69 
 
 		 577 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.600681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1698  dihydroxy-acid dehydratase  48.76 
 
 		 579 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5407  dihydroxy-acid dehydratase  47.61 
 
 		 578 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205419  decreased coverage  0.00130415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2821  dihydroxy-acid dehydratase  47.89 
 
 		 576 aa  547  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3912  dihydroxy-acid dehydratase  48.42 
 
 		 575 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000220619  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4465  dihydroxy-acid dehydratase  49.74 
 
 		 580 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.98361  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5697  dihydroxy-acid dehydratase  49.65 
 
 		 587 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3759  dihydroxyacid dehydratase  50.27 
 
 		 591 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2470  dihydroxy-acid dehydratase  48.85 
 
 		 567 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726084  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0433  dihydroxy-acid dehydratase  47.1 
 
 		 586 aa  504  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1318  dihydroxy-acid dehydratase  48.03 
 
 		 575 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2834  dihydroxy-acid dehydratase  46.74 
 
 		 568 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0037  dihydroxy-acid dehydratase  48.63 
 
 		 629 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3191  dihydroxy-acid dehydratase  46.76 
 
 		 566 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2448  dihydroxy-acid dehydratase  48.2 
 
 		 568 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0884  dihydroxy-acid dehydratase  47.06 
 
 		 582 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00253808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3810  dihydroxy-acid dehydratase  46.99 
 
 		 584 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4562  dihydroxy-acid dehydratase  47.27 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3757  dihydroxy-acid dehydratase  48.09 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6261  dihydroxy-acid dehydratase  47.36 
 
 		 584 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3955  dihydroxy-acid dehydratase  46.32 
 
 		 570 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3247  dihydroxy-acid dehydratase  47.13 
 
 		 569 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.652611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0453  dihydroxy-acid dehydratase  48.01 
 
 		 571 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5831  dihydroxy-acid dehydratase  47.36 
 
 		 590 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3950  dihydroxy-acid dehydratase  47.54 
 
 		 587 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>