More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0456 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  67.88 
 
 		 578 aa  773    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  62.59 
 
 		 578 aa  723    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  65.12 
 
 		 578 aa  760    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  79.79 
 
 		 583 aa  965    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  82.26 
 
 		 580 aa  982    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  73.92 
 
 		 577 aa  894    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  82.09 
 
 		 580 aa  979    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  63.35 
 
 		 579 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  81.74 
 
 		 578 aa  976    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  79.45 
 
 		 583 aa  958    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  63.24 
 
 		 574 aa  715    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  65.92 
 
 		 600 aa  756    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  79.07 
 
 		 583 aa  957    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  78.6 
 
 		 583 aa  951    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  82.01 
 
 		 583 aa  983    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  83.51 
 
 		 580 aa  1006    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 579 aa  1189    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  60.88 
 
 		 569 aa  676    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  65.17 
 
 		 579 aa  738    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  66.96 
 
 		 577 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  80.84 
 
 		 578 aa  968    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  81.44 
 
 		 581 aa  988    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  80.84 
 
 		 578 aa  968    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  61.47 
 
 		 568 aa  713    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  59.72 
 
 		 571 aa  676    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  79.79 
 
 		 583 aa  965    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  62.7 
 
 		 569 aa  737    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  81.36 
 
 		 577 aa  971    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  66.15 
 
 		 581 aa  776    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  61.36 
 
 		 572 aa  711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  74.44 
 
 		 577 aa  897    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  74.44 
 
 		 577 aa  897    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  79.07 
 
 		 583 aa  957    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  66.78 
 
 		 577 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  66.61 
 
 		 581 aa  781    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  65.27 
 
 		 586 aa  769    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  79.79 
 
 		 583 aa  965    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  74.44 
 
 		 586 aa  897    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  79.11 
 
 		 583 aa  957    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  62 
 
 		 570 aa  719    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  77.7 
 
 		 580 aa  945    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  65.1 
 
 		 582 aa  752    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  68.06 
 
 		 570 aa  793    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  73.75 
 
 		 577 aa  894    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  63.18 
 
 		 579 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  82.21 
 
 		 577 aa  978    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  84.8 
 
 		 579 aa  1031    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  65.45 
 
 		 578 aa  757    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  80.76 
 
 		 577 aa  956    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  83.28 
 
 		 577 aa  1002    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  67.19 
 
 		 569 aa  777    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  83.71 
 
 		 578 aa  987    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  53.39 
 
 		 579 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  56.29 
 
 		 569 aa  613  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0539  dihydroxy-acid dehydratase  50.44 
 
 		 578 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4217  dihydroxy-acid dehydratase  51.96 
 
 		 580 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298281  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0143  Dihydroxy-acid dehydratase  51.13 
 
 		 586 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3320  dihydroxy-acid dehydratase  51.79 
 
 		 574 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 		 586 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4447  Dihydroxy-acid dehydratase  50.78 
 
 		 580 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  51.91 
 
 		 575 aa  548  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2121  dihydroxy-acid dehydratase  49.38 
 
 		 576 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40195  normal  0.0621198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0518  dihydroxy-acid dehydratase  48.67 
 
 		 573 aa  542  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000961821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4283  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 601 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3404  dihydroxy-acid dehydratase  48.78 
 
 		 576 aa  541  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5385  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 		 582 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585495  normal  0.849762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2297  dihydroxy-acid dehydratase  47.83 
 
 		 579 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0371112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1958  Dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 574 aa  532  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0224765  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5271  dihydroxy-acid dehydratase  48.3 
 
 		 594 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3912  dihydroxy-acid dehydratase  47.89 
 
 		 575 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000220619  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2210  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 576 aa  530  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703379  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1698  dihydroxy-acid dehydratase  47.8 
 
 		 579 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6247  dihydroxy-acid dehydratase  47.8 
 
 		 577 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.600681 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5711  dihydroxy-acid dehydratase  47.98 
 
 		 575 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0870654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2821  dihydroxy-acid dehydratase  47.59 
 
 		 576 aa  522  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5349  dihydroxy-acid dehydratase  48.42 
 
 		 578 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.7217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4022  dihydroxy-acid dehydratase  48.06 
 
 		 573 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5407  dihydroxy-acid dehydratase  47.71 
 
 		 578 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205419  decreased coverage  0.00130415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3759  dihydroxyacid dehydratase  48.77 
 
 		 591 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5057  dihydroxy-acid dehydratase  48.57 
 
 		 578 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5697  dihydroxy-acid dehydratase  49.04 
 
 		 587 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3343  dihydroxy-acid dehydratase  48.3 
 
 		 577 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4465  dihydroxy-acid dehydratase  48.21 
 
 		 580 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.98361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2448  dihydroxy-acid dehydratase  48.19 
 
 		 568 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2470  dihydroxy-acid dehydratase  49.11 
 
 		 567 aa  490  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726084  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0433  dihydroxy-acid dehydratase  48.21 
 
 		 586 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0037  dihydroxy-acid dehydratase  48.81 
 
 		 629 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0884  dihydroxy-acid dehydratase  48.54 
 
 		 582 aa  485  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00253808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3648  dihydroxy-acid dehydratase  47.82 
 
 		 599 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.458648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1318  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 		 575 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6261  dihydroxy-acid dehydratase  47.49 
 
 		 584 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3247  dihydroxy-acid dehydratase  47.77 
 
 		 569 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.652611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5831  dihydroxy-acid dehydratase  48.26 
 
 		 590 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3551  dihydroxy-acid dehydratase  46.81 
 
 		 607 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3810  dihydroxy-acid dehydratase  47.62 
 
 		 584 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2216  dihydroxy-acid dehydratase  47.29 
 
 		 569 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2095  dihydroxy-acid dehydratase  46.23 
 
 		 602 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3962  dihydroxy-acid dehydratase  46.31 
 
 		 602 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0882  dihydroxy-acid dehydratase  48.04 
 
 		 601 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2834  dihydroxy-acid dehydratase  46.14 
 
 		 568 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>