More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4447 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5697  dihydroxy-acid dehydratase  57.87 
 
 		 587 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2121  dihydroxy-acid dehydratase  59.38 
 
 		 576 aa  720    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40195  normal  0.0621198 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5407  dihydroxy-acid dehydratase  63.28 
 
 		 578 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205419  decreased coverage  0.00130415 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6247  dihydroxy-acid dehydratase  60.9 
 
 		 577 aa  756    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.600681 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5349  dihydroxy-acid dehydratase  63.1 
 
 		 578 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.7217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2210  dihydroxy-acid dehydratase  65.92 
 
 		 576 aa  776    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703379  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4022  dihydroxy-acid dehydratase  62.94 
 
 		 573 aa  739    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3320  dihydroxy-acid dehydratase  59.66 
 
 		 574 aa  724    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5711  dihydroxy-acid dehydratase  62.75 
 
 		 575 aa  738    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0870654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4217  dihydroxy-acid dehydratase  60.74 
 
 		 580 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298281  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2297  dihydroxy-acid dehydratase  61.27 
 
 		 579 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0371112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2821  dihydroxy-acid dehydratase  59.69 
 
 		 576 aa  727    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5057  dihydroxy-acid dehydratase  61.79 
 
 		 578 aa  744    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 586 aa  1211    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3343  dihydroxy-acid dehydratase  61.49 
 
 		 577 aa  727    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5271  dihydroxy-acid dehydratase  61.37 
 
 		 594 aa  755    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0539  dihydroxy-acid dehydratase  61.62 
 
 		 578 aa  757    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4465  dihydroxy-acid dehydratase  61.1 
 
 		 580 aa  732    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.98361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4283  dihydroxy-acid dehydratase  88.03 
 
 		 601 aa  1079    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0518  dihydroxy-acid dehydratase  56.94 
 
 		 573 aa  704    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000961821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3912  dihydroxy-acid dehydratase  60.49 
 
 		 575 aa  723    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000220619  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5385  dihydroxy-acid dehydratase  77.72 
 
 		 582 aa  946    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585495  normal  0.849762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1698  dihydroxy-acid dehydratase  60.59 
 
 		 579 aa  731    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3404  dihydroxy-acid dehydratase  61.81 
 
 		 576 aa  718    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  53.16 
 
 		 578 aa  616  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  54.46 
 
 		 582 aa  612  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  52.39 
 
 		 581 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  52.85 
 
 		 600 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  54.05 
 
 		 579 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  53.19 
 
 		 578 aa  607  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  52.44 
 
 		 577 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  51.67 
 
 		 578 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  51.5 
 
 		 579 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  53.45 
 
 		 570 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  52.01 
 
 		 577 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  51.61 
 
 		 579 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  50.96 
 
 		 574 aa  594  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  51.42 
 
 		 578 aa  586  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  51.44 
 
 		 571 aa  581  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0143  Dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 		 586 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4447  Dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 		 580 aa  577  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 572 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  49.47 
 
 		 568 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  52.42 
 
 		 578 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 		 581 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 569 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  52.26 
 
 		 569 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 		 578 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  50.26 
 
 		 586 aa  568  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 569 aa  564  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  49.38 
 
 		 577 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  50.44 
 
 		 580 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 578 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 578 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 		 579 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  51.79 
 
 		 577 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1958  Dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 574 aa  550  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0224765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 577 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  49.38 
 
 		 579 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 		 577 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  49.03 
 
 		 580 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  49.03 
 
 		 580 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  49.74 
 
 		 583 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  48.89 
 
 		 579 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 581 aa  547  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 		 577 aa  545  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  48.04 
 
 		 580 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  47.27 
 
 		 570 aa  545  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  50.35 
 
 		 583 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  50.35 
 
 		 583 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  50.35 
 
 		 583 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  49.56 
 
 		 583 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  50.79 
 
 		 569 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  49.56 
 
 		 583 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  49.65 
 
 		 583 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  49.65 
 
 		 583 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  49.65 
 
 		 583 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  49.38 
 
 		 586 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  49.2 
 
 		 577 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  49.2 
 
 		 577 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 		 577 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3759  dihydroxyacid dehydratase  48.12 
 
 		 591 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2470  dihydroxy-acid dehydratase  48.82 
 
 		 567 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1318  dihydroxy-acid dehydratase  47.85 
 
 		 575 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3191  dihydroxy-acid dehydratase  47.12 
 
 		 566 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2448  dihydroxy-acid dehydratase  48.03 
 
 		 568 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0433  dihydroxy-acid dehydratase  47.35 
 
 		 586 aa  508  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  48.33 
 
 		 575 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2834  dihydroxy-acid dehydratase  46.58 
 
 		 568 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2216  dihydroxy-acid dehydratase  47.04 
 
 		 569 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3950  dihydroxy-acid dehydratase  47.45 
 
 		 587 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0453  dihydroxy-acid dehydratase  48.39 
 
 		 571 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3757  dihydroxy-acid dehydratase  48 
 
 		 570 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0037  dihydroxy-acid dehydratase  46.91 
 
 		 629 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4562  dihydroxy-acid dehydratase  45.55 
 
 		 570 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5831  dihydroxy-acid dehydratase  46.73 
 
 		 590 aa  485  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3247  dihydroxy-acid dehydratase  46.86 
 
 		 569 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.652611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3810  dihydroxy-acid dehydratase  45 
 
 		 584 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0884  dihydroxy-acid dehydratase  46 
 
 		 582 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00253808  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6261  dihydroxy-acid dehydratase  47.99 
 
 		 584 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>