More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1022 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  70.93 
 
 
570 aa  836    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  62.92 
 
 
579 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  60.11 
 
 
570 aa  709    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  68.06 
 
 
578 aa  779    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  66.9 
 
 
580 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  66.55 
 
 
580 aa  756    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  68.44 
 
 
583 aa  778    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  68.12 
 
 
578 aa  773    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  61.58 
 
 
568 aa  723    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  68.44 
 
 
583 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  63.05 
 
 
574 aa  724    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  69.67 
 
 
577 aa  839    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  62.11 
 
 
572 aa  713    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  67.88 
 
 
578 aa  777    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  67.7 
 
 
583 aa  763    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  92.82 
 
 
578 aa  1097    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  62.52 
 
 
579 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  68.27 
 
 
583 aa  781    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  68.58 
 
 
583 aa  783    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  65.92 
 
 
579 aa  756    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  66.2 
 
 
578 aa  754    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  68.79 
 
 
579 aa  820    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  70.54 
 
 
577 aa  841    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  63.9 
 
 
581 aa  757    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  64.8 
 
 
578 aa  743    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  62.05 
 
 
577 aa  731    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  63.46 
 
 
571 aa  739    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  68.44 
 
 
583 aa  778    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  68 
 
 
578 aa  818    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  61.5 
 
 
580 aa  717    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  58.84 
 
 
569 aa  638    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  64.7 
 
 
581 aa  771    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  63.83 
 
 
586 aa  773    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  62.65 
 
 
577 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  62.65 
 
 
577 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  68.27 
 
 
583 aa  781    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  66.9 
 
 
577 aa  777    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  66.32 
 
 
581 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  68.44 
 
 
583 aa  778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  60.46 
 
 
569 aa  736    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  62.22 
 
 
586 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  89.55 
 
 
578 aa  1061    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  65.67 
 
 
582 aa  768    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  61.35 
 
 
577 aa  718    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  64.16 
 
 
569 aa  732    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
600 aa  1224    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  68.71 
 
 
577 aa  769    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  66.14 
 
 
579 aa  758    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  67.07 
 
 
583 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  67.66 
 
 
577 aa  750    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  64.7 
 
 
580 aa  758    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  66.02 
 
 
569 aa  744    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  66.49 
 
 
577 aa  756    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  55.11 
 
 
579 aa  631  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8653  dihydroxy-acid and 6-phosphogluconate dehydratase  89.88 
 
 
386 aa  618  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  56.33 
 
 
575 aa  613  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  52.85 
 
 
586 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4283  dihydroxy-acid dehydratase  52.31 
 
 
601 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0539  dihydroxy-acid dehydratase  51.86 
 
 
578 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4447  Dihydroxy-acid dehydratase  54.24 
 
 
580 aa  601  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4217  dihydroxy-acid dehydratase  52.77 
 
 
580 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298281  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0143  Dihydroxy-acid dehydratase  54.56 
 
 
586 aa  592  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0518  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 
573 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000961821  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5711  dihydroxy-acid dehydratase  51.66 
 
 
575 aa  591  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0870654  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5385  dihydroxy-acid dehydratase  51.95 
 
 
582 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585495  normal  0.849762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2121  dihydroxy-acid dehydratase  51.48 
 
 
576 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40195  normal  0.0621198 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5697  dihydroxy-acid dehydratase  52.48 
 
 
587 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1698  dihydroxy-acid dehydratase  50.26 
 
 
579 aa  578  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471971  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5271  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3404  dihydroxy-acid dehydratase  50.7 
 
 
576 aa  578  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2297  dihydroxy-acid dehydratase  49.65 
 
 
579 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0371112  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3912  dihydroxy-acid dehydratase  50.44 
 
 
575 aa  575  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000220619  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2210  dihydroxy-acid dehydratase  52.31 
 
 
576 aa  571  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703379  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3320  dihydroxy-acid dehydratase  51.14 
 
 
574 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195004  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5407  dihydroxy-acid dehydratase  48.17 
 
 
578 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205419  decreased coverage  0.00130415 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5349  dihydroxy-acid dehydratase  47.82 
 
 
578 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.7217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1958  Dihydroxy-acid dehydratase  51.44 
 
 
574 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0224765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3343  dihydroxy-acid dehydratase  49.38 
 
 
577 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4022  dihydroxy-acid dehydratase  50.35 
 
 
573 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2821  dihydroxy-acid dehydratase  47.72 
 
 
576 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6247  dihydroxy-acid dehydratase  48.4 
 
 
577 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.600681 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5057  dihydroxy-acid dehydratase  49.65 
 
 
578 aa  548  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4465  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
580 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.98361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3759  dihydroxyacid dehydratase  49.31 
 
 
591 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0037  dihydroxy-acid dehydratase  50.28 
 
 
629 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3950  dihydroxy-acid dehydratase  48.81 
 
 
587 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776785  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6261  dihydroxy-acid dehydratase  49.56 
 
 
584 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2834  dihydroxy-acid dehydratase  49.63 
 
 
568 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5831  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 
590 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2448  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 
568 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3810  dihydroxy-acid dehydratase  49.36 
 
 
584 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2470  dihydroxy-acid dehydratase  49.54 
 
 
567 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3247  dihydroxy-acid dehydratase  50.83 
 
 
569 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.652611  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3191  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
566 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0884  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 
582 aa  502  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00253808  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2216  dihydroxy-acid dehydratase  50.37 
 
 
569 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1318  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
575 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0433  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 
586 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3955  dihydroxy-acid dehydratase  47.77 
 
 
570 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3757  dihydroxy-acid dehydratase  47.26 
 
 
570 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>