More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4105 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  67.25 
 
 		 578 aa  787    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  67.13 
 
 		 583 aa  793    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  63.46 
 
 		 577 aa  760    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  63.83 
 
 		 600 aa  773    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  79.61 
 
 		 569 aa  976    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  64.12 
 
 		 580 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  65.32 
 
 		 578 aa  784    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  64.29 
 
 		 580 aa  762    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  60.84 
 
 		 578 aa  720    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  64.69 
 
 		 577 aa  769    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  65.04 
 
 		 578 aa  770    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  66.26 
 
 		 578 aa  774    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  66.95 
 
 		 583 aa  792    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 586 aa  1207    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  63.48 
 
 		 578 aa  768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  66.2 
 
 		 570 aa  802    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  66.72 
 
 		 583 aa  797    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  57.89 
 
 		 569 aa  666    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  65.86 
 
 		 583 aa  776    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  67.6 
 
 		 577 aa  820    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  75.13 
 
 		 581 aa  914    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  65.27 
 
 		 579 aa  769    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  60.7 
 
 		 570 aa  724    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  66.84 
 
 		 579 aa  790    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  56.22 
 
 		 569 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  67.25 
 
 		 577 aa  814    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  64.93 
 
 		 581 aa  778    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  59.58 
 
 		 568 aa  727    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  61.3 
 
 		 572 aa  726    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  59.33 
 
 		 571 aa  690    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  67.13 
 
 		 583 aa  793    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  65.8 
 
 		 580 aa  787    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  86.01 
 
 		 581 aa  1045    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  59.23 
 
 		 574 aa  705    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  65.1 
 
 		 577 aa  779    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  65.1 
 
 		 577 aa  779    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  66.61 
 
 		 583 aa  792    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  67.13 
 
 		 583 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  67.25 
 
 		 578 aa  787    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  79.23 
 
 		 579 aa  961    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  79.41 
 
 		 579 aa  963    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  65.1 
 
 		 586 aa  780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  77.51 
 
 		 582 aa  952    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  66.44 
 
 		 583 aa  791    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  66.67 
 
 		 578 aa  802    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  64.52 
 
 		 580 aa  778    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  67.13 
 
 		 577 aa  795    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  64.57 
 
 		 579 aa  781    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  65.73 
 
 		 577 aa  784    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  66.78 
 
 		 577 aa  782    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  66.73 
 
 		 577 aa  781    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  65.44 
 
 		 569 aa  782    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  66.61 
 
 		 583 aa  792    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  54.14 
 
 		 579 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  52.69 
 
 		 575 aa  589  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0518  dihydroxy-acid dehydratase  51.79 
 
 		 573 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000961821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0143  Dihydroxy-acid dehydratase  52.77 
 
 		 586 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4447  Dihydroxy-acid dehydratase  51.25 
 
 		 580 aa  568  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 586 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3320  dihydroxy-acid dehydratase  49.11 
 
 		 574 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4217  dihydroxy-acid dehydratase  49.11 
 
 		 580 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298281  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4283  dihydroxy-acid dehydratase  47.65 
 
 		 601 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5385  dihydroxy-acid dehydratase  48.04 
 
 		 582 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.585495  normal  0.849762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5271  dihydroxy-acid dehydratase  45.99 
 
 		 594 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1958  Dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 		 574 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0224765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2121  dihydroxy-acid dehydratase  46.47 
 
 		 576 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40195  normal  0.0621198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0539  dihydroxy-acid dehydratase  47.01 
 
 		 578 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2297  dihydroxy-acid dehydratase  47.47 
 
 		 579 aa  534  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0371112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4022  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 		 573 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2210  dihydroxy-acid dehydratase  47.42 
 
 		 576 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703379  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5711  dihydroxy-acid dehydratase  46.65 
 
 		 575 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0870654  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5697  dihydroxy-acid dehydratase  48.69 
 
 		 587 aa  525  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1698  dihydroxy-acid dehydratase  46.58 
 
 		 579 aa  525  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6247  dihydroxy-acid dehydratase  46.52 
 
 		 577 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.600681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3404  dihydroxy-acid dehydratase  46.38 
 
 		 576 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3912  dihydroxy-acid dehydratase  45.61 
 
 		 575 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000220619  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2821  dihydroxy-acid dehydratase  45.05 
 
 		 576 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5349  dihydroxy-acid dehydratase  45.2 
 
 		 578 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.7217 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5407  dihydroxy-acid dehydratase  45.03 
 
 		 578 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205419  decreased coverage  0.00130415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3343  dihydroxy-acid dehydratase  45.68 
 
 		 577 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5057  dihydroxy-acid dehydratase  47.16 
 
 		 578 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3759  dihydroxyacid dehydratase  45.87 
 
 		 591 aa  500  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3648  dihydroxy-acid dehydratase  48.44 
 
 		 599 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.458648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3116  dihydroxy-acid dehydratase  44.78 
 
 		 595 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3962  dihydroxy-acid dehydratase  47.57 
 
 		 602 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0037  dihydroxy-acid dehydratase  46.88 
 
 		 629 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2095  dihydroxy-acid dehydratase  46.14 
 
 		 602 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3324  dihydroxy-acid dehydratase  47.64 
 
 		 602 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0087  dihydroxy-acid dehydratase  47.57 
 
 		 593 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4465  dihydroxy-acid dehydratase  45.77 
 
 		 580 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.98361  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0882  dihydroxy-acid dehydratase  49.08 
 
 		 601 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0940  dihydroxy-acid dehydratase  49.08 
 
 		 601 aa  488  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234508  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3950  dihydroxy-acid dehydratase  46.62 
 
 		 587 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776785  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1421  dihydroxy-acid dehydratase  48.8 
 
 		 601 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1675  dihydroxy-acid dehydratase  48.89 
 
 		 603 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.75973  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3694  dihydroxy-acid dehydratase  44.41 
 
 		 598 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0884  dihydroxy-acid dehydratase  46.29 
 
 		 582 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00253808  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1359  dihydroxy-acid dehydratase  44.16 
 
 		 594 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188319  normal  0.638946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0433  dihydroxy-acid dehydratase  45.28 
 
 		 586 aa  484  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6403  dihydroxy-acid dehydratase  45.01 
 
 		 595 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>