More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2095 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07358  hypothetical dihydroxy-acid dehydratase (Eurofung)  64.81 
 
 
651 aa  805    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0940  dihydroxy-acid dehydratase  74.96 
 
 
601 aa  926    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0861  dihydroxy-acid dehydratase  63.91 
 
 
594 aa  798    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.159597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6403  dihydroxy-acid dehydratase  68.3 
 
 
595 aa  852    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04770  dihydroxy-acid dehydratase, putative  64.19 
 
 
636 aa  767    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3093  dihydroxy-acid dehydratase  64.25 
 
 
594 aa  776    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0227397 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0176  dihydroxy-acid dehydratase  67 
 
 
593 aa  807    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1998  dihydroxy-acid dehydratase  78.85 
 
 
604 aa  963    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701695  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1467  dihydroxy-acid dehydratase  67.01 
 
 
593 aa  797    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.454096  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2904  dihydroxy-acid dehydratase  71.67 
 
 
601 aa  841    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795928  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0882  dihydroxy-acid dehydratase  75.29 
 
 
601 aa  931    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3116  dihydroxy-acid dehydratase  66.78 
 
 
595 aa  822    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583014  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0087  dihydroxy-acid dehydratase  70.78 
 
 
593 aa  850    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4905  dihydroxy-acid dehydratase  73.43 
 
 
603 aa  883    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.751996  hitchhiker  0.00289636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2095  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
602 aa  1239    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0987  dihydroxy-acid dehydratase  66.16 
 
 
617 aa  793    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.076567  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6168  dihydroxy-acid dehydratase  66.28 
 
 
598 aa  822    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.017336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3648  dihydroxy-acid dehydratase  91.89 
 
 
599 aa  1137    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.458648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3551  dihydroxy-acid dehydratase  86.82 
 
 
607 aa  1083    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347944  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1359  dihydroxy-acid dehydratase  66.11 
 
 
594 aa  841    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188319  normal  0.638946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3694  dihydroxy-acid dehydratase  67.11 
 
 
598 aa  847    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3324  dihydroxy-acid dehydratase  96.35 
 
 
602 aa  1203    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1145  dihydroxy-acid dehydratase  68.53 
 
 
600 aa  849    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6461  dihydroxy-acid dehydratase  67.4 
 
 
593 aa  833    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4493  dihydroxy-acid dehydratase  63.46 
 
 
586 aa  767    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2875  dihydroxy-acid dehydratase  75.13 
 
 
599 aa  921    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284792  normal  0.328193 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1421  dihydroxy-acid dehydratase  74.79 
 
 
601 aa  925    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3962  dihydroxy-acid dehydratase  92.03 
 
 
602 aa  1149    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1326  dihydroxy-acid dehydratase  71.62 
 
 
599 aa  859    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214365  normal  0.115869 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4082  dihydroxy-acid dehydratase  67 
 
 
594 aa  806    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2457  dihydroxy-acid dehydratase  64.87 
 
 
593 aa  777    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000103031 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4584  dihydroxy-acid dehydratase  67.23 
 
 
593 aa  808    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6696  dihydroxy-acid dehydratase  67.4 
 
 
593 aa  833    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6298  dihydroxy-acid dehydratase  67.23 
 
 
593 aa  831    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3617  dihydroxy-acid dehydratase  68.77 
 
 
599 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.886843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3350  dihydroxy-acid dehydratase  64.71 
 
 
594 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.907345  hitchhiker  0.00746579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1810  dihydroxy-acid dehydratase  66.84 
 
 
593 aa  804    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4003  dihydroxy-acid dehydratase  63.85 
 
 
597 aa  785    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3613  dihydroxy-acid dehydratase  72.8 
 
 
600 aa  884    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772791  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0754  dihydroxy-acid dehydratase  64.53 
 
 
593 aa  766    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4194  dihydroxy-acid dehydratase  67 
 
 
594 aa  806    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1675  dihydroxy-acid dehydratase  73.6 
 
 
603 aa  889    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.75973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2488  dihydroxy-acid dehydratase  65.09 
 
 
592 aa  791    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0940  dihydroxy-acid dehydratase  65.59 
 
 
592 aa  785    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  46.14 
 
 
586 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  46.03 
 
 
570 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  46.32 
 
 
578 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  46.79 
 
 
577 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  46.4 
 
 
581 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  47.57 
 
 
577 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  46.56 
 
 
581 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  46.23 
 
 
579 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  45.83 
 
 
577 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  46.47 
 
 
569 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  47.6 
 
 
577 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  47.6 
 
 
577 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  47.6 
 
 
577 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  44.98 
 
 
579 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  44.91 
 
 
583 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  45.82 
 
 
578 aa  465  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  45.94 
 
 
578 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  47.23 
 
 
586 aa  465  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  47.42 
 
 
577 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  44.64 
 
 
579 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  44.88 
 
 
582 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  44.06 
 
 
580 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  44.33 
 
 
580 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  44.41 
 
 
580 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  44.48 
 
 
581 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  45.61 
 
 
578 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  44.33 
 
 
580 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  45.06 
 
 
583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  44.56 
 
 
583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  45.06 
 
 
583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  44.72 
 
 
583 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  46.01 
 
 
577 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  44.24 
 
 
579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  44.22 
 
 
583 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  44.39 
 
 
583 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  44.39 
 
 
583 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  44.17 
 
 
577 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  43.65 
 
 
583 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  44.03 
 
 
578 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  44.67 
 
 
568 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  43.36 
 
 
578 aa  445  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  43.19 
 
 
600 aa  439  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  45.36 
 
 
577 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  44.88 
 
 
572 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  43.52 
 
 
578 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  43.31 
 
 
579 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  44.14 
 
 
574 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  42.86 
 
 
570 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  44.1 
 
 
569 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  45.64 
 
 
571 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  41.99 
 
 
569 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  46.11 
 
 
569 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  41.99 
 
 
578 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  42.02 
 
 
586 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1958  Dihydroxy-acid dehydratase  43.23 
 
 
574 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0224765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  42.66 
 
 
575 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>