More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0218 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0218  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
173 aa  333  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.27 
 
 
580 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  66.86 
 
 
559 aa  204  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  66.28 
 
 
586 aa  203  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.86 
 
 
572 aa  202  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.27 
 
 
559 aa  197  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5547  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.5 
 
 
520 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  62.79 
 
 
585 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.95 
 
 
589 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.95 
 
 
591 aa  195  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.696887  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.95 
 
 
591 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.91 
 
 
569 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.87 
 
 
585 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.53 
 
 
594 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.35 
 
 
579 aa  193  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.31 
 
 
576 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448898  normal  0.153923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.67 
 
 
680 aa  194  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.27 
 
 
527 aa  193  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.68 
 
 
755 aa  192  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422723  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.86 
 
 
579 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.82 
 
 
793 aa  192  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143361  normal  0.380239 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.95 
 
 
519 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4450  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.12 
 
 
519 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000313766  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  58.96 
 
 
557 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.96 
 
 
557 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.42 
 
 
740 aa  191  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  58.96 
 
 
557 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0687  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.66 
 
 
433 aa  191  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.16 
 
 
577 aa  191  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.86 
 
 
559 aa  191  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1618  chemotaxis sensory transducer  62.28 
 
 
557 aa  191  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.126465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4446  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.03 
 
 
605 aa  190  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0260008  normal  0.622584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.03 
 
 
605 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0928828 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0152  methyl-accepting chemotaxis protein  65.27 
 
 
565 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  64.85 
 
 
551 aa  189  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0176  methyl-accepting chemotaxis protein  65.27 
 
 
565 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1029  methyl-accepting chemotaxis protein  65.27 
 
 
562 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1321  methyl-accepting chemotaxis protein  65.27 
 
 
565 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2620  methyl-accepting chemotaxis protein  65.27 
 
 
562 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2764  methyl-accepting chemotaxis protein  65.27 
 
 
562 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1224  aerotaxis sensor receptor transmembrane protein  61.21 
 
 
514 aa  188  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229455  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  61.82 
 
 
579 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00885268  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00045  chemotaxis protein  60 
 
 
691 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505093  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.52 
 
 
519 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.28 
 
 
674 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.28 
 
 
674 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.3 
 
 
572 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.31 
 
 
644 aa  188  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000893288 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0449  methyl-accepting chemotaxis protein  65.27 
 
 
562 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.123732  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.76 
 
 
562 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2488  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  60.48 
 
 
512 aa  188  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.28 
 
 
549 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  63.69 
 
 
513 aa  187  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.21 
 
 
584 aa  187  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0129  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.79 
 
 
511 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469561  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.54 
 
 
583 aa  187  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  65.87 
 
 
566 aa  187  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.24 
 
 
615 aa  187  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.24 
 
 
615 aa  187  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.72 
 
 
572 aa  187  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00054  methyl-accepting chemotaxis protein  61.08 
 
 
797 aa  187  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.276697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.06 
 
 
516 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0335  methyl-accepting chemotaxis protein I  61.9 
 
 
394 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.809135  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.88 
 
 
587 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.12 
 
 
562 aa  186  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0379  methyl-accepting chemotaxis protein  63.37 
 
 
542 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366227  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.43 
 
 
605 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.76 
 
 
536 aa  186  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000611014  hitchhiker  0.00000521325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.82 
 
 
598 aa  186  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2548  methyl-accepting chemotaxis protein  57.99 
 
 
525 aa  185  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00975221  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.9 
 
 
578 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.43 
 
 
570 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.12 
 
 
745 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.195185 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.28 
 
 
511 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51282  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  60 
 
 
547 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6336  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.03 
 
 
581 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794546  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  60 
 
 
547 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  60 
 
 
547 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.21 
 
 
598 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.197645  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02220  putative chemotaxis transducer  64.67 
 
 
679 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329962  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.36 
 
 
622 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.13 
 
 
595 aa  185  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.9 
 
 
580 aa  185  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.88 
 
 
597 aa  185  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0256  chemotaxis transducer  64.67 
 
 
679 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.71 
 
 
542 aa  184  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2587  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.18 
 
 
550 aa  184  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.83115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.28 
 
 
499 aa  184  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  59.28 
 
 
598 aa  184  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0881  methyl-accepting chemotaxis protein  63.53 
 
 
661 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.29 
 
 
525 aa  184  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770374  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1169  methyl-accepting chemotaxis protein  63.53 
 
 
542 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.58 
 
 
512 aa  184  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2538  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.52 
 
 
521 aa  184  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0549264  normal  0.252917 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2146  methyl-accepting chemotaxis protein  63.53 
 
 
542 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1733  methyl-accepting chemotaxis protein I  63.53 
 
 
661 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2191  methyl-accepting chemotaxis protein  62.35 
 
 
666 aa  184  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.61 
 
 
584 aa  184  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.89 
 
 
567 aa  184  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.67 
 
 
620 aa  184  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244601  normal  0.213177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>