207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1967 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1967  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 
322 aa  648    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  35.81 
 
 
407 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.22 
 
 
669 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.64 
 
 
668 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.36 
 
 
668 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.36 
 
 
668 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  30.77 
 
 
467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.76 
 
 
673 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.88 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  32.95 
 
 
432 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  35.71 
 
 
657 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.39 
 
 
668 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5013  putative nitrate transport protein  35.57 
 
 
338 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.826042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30.65 
 
 
669 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30.65 
 
 
669 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  31.75 
 
 
407 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.71 
 
 
350 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.92 
 
 
667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.72 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4960  putative nitrate transport protein  35.04 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.13 
 
 
385 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4497  putative nitrate transport protein  34.9 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.26 
 
 
353 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  29.74 
 
 
423 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.6 
 
 
663 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2301  putative nitrate transport protein  35.52 
 
 
333 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  32.57 
 
 
353 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  35.34 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.34 
 
 
353 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  32.57 
 
 
353 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  28.11 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  29.37 
 
 
405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  32.88 
 
 
406 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  35.06 
 
 
382 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.33 
 
 
383 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.75 
 
 
410 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  32.95 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.97 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.97 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.28 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  30.2 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  32.53 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  32.53 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  32.53 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  32.53 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  32.53 
 
 
353 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1734  nitrate transporter, putative  30.8 
 
 
361 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918495  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  29.73 
 
 
425 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  29.02 
 
 
433 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  28.76 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  31.38 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  34 
 
 
402 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  28.57 
 
 
443 aa  109  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  33.2 
 
 
402 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  29.89 
 
 
387 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  27.53 
 
 
403 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  27.73 
 
 
431 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  29.76 
 
 
435 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  30.38 
 
 
423 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 
430 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  32.87 
 
 
370 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.37 
 
 
427 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 
430 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  27.34 
 
 
437 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 
430 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  28.4 
 
 
386 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  31.56 
 
 
440 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  26.95 
 
 
437 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  29.07 
 
 
386 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  26.1 
 
 
454 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  27.63 
 
 
392 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  25.38 
 
 
438 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  31.2 
 
 
415 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1968  nitrate transport protein, NrtC like protein  27.59 
 
 
444 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  32.3 
 
 
377 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  28.29 
 
 
414 aa  99.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  31.02 
 
 
425 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3742  putative nitrate transport protein  35.38 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  29.76 
 
 
403 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  27.6 
 
 
437 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 
434 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  28.91 
 
 
400 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  29.64 
 
 
403 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  25.59 
 
 
427 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  30.27 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.2 
 
 
659 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  24.61 
 
 
444 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  28.8 
 
 
434 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  24.61 
 
 
444 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.35 
 
 
403 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  30.04 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  25.59 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  30.27 
 
 
421 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  29.57 
 
 
418 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  29.57 
 
 
404 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  25.58 
 
 
442 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  26.07 
 
 
414 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  21.69 
 
 
457 aa  96.3  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  23.19 
 
 
466 aa  95.9  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  24.69 
 
 
486 aa  95.9  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.511943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>