102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_22690  DnaK suppressor protein  100 
 
 		 114 aa  219  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  45.63 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4329  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.4 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  41.38 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.57 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.38 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.04 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.44 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0744  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.86 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.186685  normal  0.0218217 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  52.17 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  46.67 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  46.67 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.74 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.19 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  46 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  50 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2384  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  32.04 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.73 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  38 
 
 		 234 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3578  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1926  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22970  RNA polymerase-binding DksA like protein  37.38 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.55 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.51 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 251 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.55 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  46.55 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0964  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.633657  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2311  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.94 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  44 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  42 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1803  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488445  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  42 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000132063  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2068  DnaK suppressor protein  44 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000191774  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0114  RNA polymerase-binding protein DksA  44 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000001721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.19 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  42 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.98 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  42 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  46 
 
 		 118 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 120 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.64 
 
 		 114 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.19 
 
 		 114 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2286  hypothetical protein  36.19 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2259  hypothetical protein  36.19 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2037  regulator RpoS  42 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.555499  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  29.81 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  44 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.97 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  35.56 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0169  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.65 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.2184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.22 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2024  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.94 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1419  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.94 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597542  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2340  TraR/DksA family transcriptional regulator  42 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1334  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.94 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3205  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.94 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3077  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.94 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2314  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.94 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.65 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.65 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  41.86 
 
 		 283 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1047  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.94 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.46 
 
 		 228 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  44.19 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  32.69 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1939  TraR/DksA family transcriptional regulator  46 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082918 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.54 
 
 		 210 aa  40.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42640  RNA polymerase binding protein DksA  44 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.105027  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  40.74 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4875  hypothetical protein  52.63 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  51.16 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0879  suppressor protein DksA  44 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>