More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1939 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1939  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  51.52 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  51.52 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22970  RNA polymerase-binding DksA like protein  50.76 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1232  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  41.79 
 
 		 228 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0071  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.21 
 
 		 223 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  42.64 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  42.64 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  42.64 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  42.64 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  42.64 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  42.64 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  42.64 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  42.64 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4379  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2476  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3107  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.79 
 
 		 223 aa  105  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3262  dnaK suppressor protein, putative  39.85 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.75 
 
 		 162 aa  105  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.79 
 
 		 223 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3683  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 281 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3487  dnaK suppressor protein, putative  39.85 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0344  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.3 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 257 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2220  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  41.35 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3327  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1844  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0449164  normal  0.0842967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3428  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 278 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3519  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0696704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.94 
 
 		 207 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  46.77 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1064  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 450 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  41.04 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3438  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 429 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3452  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.74 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  42.74 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1243  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  40.6 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.9 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.13 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.83 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.09 
 
 		 139 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3101  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2734  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.15 
 
 		 405 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00359  DnaK supressor  43.08 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 138 aa  87  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 138 aa  87  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.83 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.8 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 313 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2819  RNA polymerase-binding transcription factor  37.98 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.02941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0307  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 313 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.02 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  39.84 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.38 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  41.38 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  40.74 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.1 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  36.89 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1032  RNA polymerase-binding transcription factor  37.21 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0218805  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  39.84 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  40 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.02 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3457  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.21 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  40 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0136  RNA polymerase-binding transcription factor  37.21 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000300013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0148  RNA polymerase-binding transcription factor  37.21 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000273463  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>