More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03440 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_03440  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  100 
 
 
257 aa  502  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.02 
 
 
259 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  42.28 
 
 
249 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 
245 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  39.36 
 
 
261 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
261 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
241 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  41.29 
 
 
252 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 
252 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
241 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 
256 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
248 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 
254 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 
254 aa  148  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
261 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  37.35 
 
 
261 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3552  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4815  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5468  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.107727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
247 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2155  short chain dehydrogenase  41.77 
 
 
245 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0553289  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
257 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
243 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
251 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
248 aa  143  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0748  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  38.37 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
258 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  40.48 
 
 
254 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
272 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
254 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0889  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122847  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0335723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.29 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
252 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
257 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
257 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.75 
 
 
249 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
248 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
252 aa  138  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.6 
 
 
247 aa  138  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  37.88 
 
 
252 aa  138  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 
257 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
281 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 
248 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 
253 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
263 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 
253 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
246 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
254 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
258 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.24 
 
 
246 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
246 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 
257 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
243 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.32 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  35.97 
 
 
263 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34 
 
 
255 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
246 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
255 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
276 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
246 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
246 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
269 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.44 
 
 
266 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
246 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
275 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.74 
 
 
288 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
249 aa  135  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>