279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5244 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5244  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  245  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  78.43 
 
 
391 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  70.59 
 
 
404 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  70.59 
 
 
404 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0136  hypothetical protein  76.92 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  72.92 
 
 
438 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  73.08 
 
 
276 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1764  hypothetical protein  68.63 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2376  hypothetical protein  68.63 
 
 
73 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  68.63 
 
 
404 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  68.63 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  61.67 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  61.67 
 
 
394 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  40.83 
 
 
411 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  65.38 
 
 
404 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  67.31 
 
 
419 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  65.38 
 
 
417 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0676  phage integrase family site specific recombinase  65.38 
 
 
303 aa  77  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.825642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  64.71 
 
 
419 aa  76.6  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  61.54 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  66.07 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  66.67 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  66.67 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  67.31 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  64.71 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  66.67 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  63.46 
 
 
394 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  68.63 
 
 
418 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  68.63 
 
 
418 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  65.38 
 
 
421 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  63.46 
 
 
394 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  63.46 
 
 
420 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  67.31 
 
 
419 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  65.38 
 
 
420 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  67.35 
 
 
404 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  65.38 
 
 
421 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  65.38 
 
 
396 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  63.46 
 
 
404 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  65.38 
 
 
421 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  62 
 
 
429 aa  73.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4839  hypothetical protein  65.38 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5703  hypothetical protein  67.35 
 
 
67 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  60.71 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  64.29 
 
 
406 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  57.69 
 
 
417 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02760  hypothetical protein  62.75 
 
 
319 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000757589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  62.75 
 
 
462 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  64.71 
 
 
396 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2095  integrase  57.69 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  62.75 
 
 
416 aa  70.5  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  59.62 
 
 
420 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  64.58 
 
 
389 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2185  integrase  58.82 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0360584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  62.75 
 
 
404 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  60.78 
 
 
404 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  60.78 
 
 
404 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  60.78 
 
 
404 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  58.82 
 
 
401 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  63.27 
 
 
424 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  59.62 
 
 
397 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  53.57 
 
 
397 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4097  phage integrase family site specific recombinase  53.57 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  62.75 
 
 
419 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  62.75 
 
 
404 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  61.22 
 
 
407 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2118  IntB  58.82 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  65.31 
 
 
425 aa  67  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  61.22 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  63.27 
 
 
425 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  67.35 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  63.27 
 
 
425 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  58.82 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  48.33 
 
 
404 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  50.98 
 
 
402 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  59.62 
 
 
395 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  55.17 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  61.22 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  61.22 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1011  integrase  63.27 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  55.17 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  56.86 
 
 
421 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  58.82 
 
 
275 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  57.41 
 
 
449 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  59.62 
 
 
404 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  46.15 
 
 
403 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  51.79 
 
 
402 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  53.33 
 
 
404 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  53.33 
 
 
404 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  56.86 
 
 
394 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  63.27 
 
 
404 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1811  hypothetical protein  62.5 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.47307 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  61.22 
 
 
428 aa  63.9  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  58 
 
 
419 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  56.86 
 
 
396 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  51.92 
 
 
420 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  56.86 
 
 
394 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  58 
 
 
424 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  51.92 
 
 
420 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  62.5 
 
 
414 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  52.94 
 
 
427 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>