121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2059 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2059  transporter, putative  100 
 
 
164 aa  315  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  59.3 
 
 
443 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  59.3 
 
 
406 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  58.29 
 
 
406 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  41.34 
 
 
426 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  44.81 
 
 
403 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  48.15 
 
 
409 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  47.12 
 
 
398 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  56.57 
 
 
352 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  58.93 
 
 
411 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 
422 aa  97.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  69.12 
 
 
411 aa  97.1  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  38.55 
 
 
410 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 
428 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  44.44 
 
 
401 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  48.15 
 
 
401 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1193  major facilitator superfamily MFS_1  54.26 
 
 
394 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754311  normal  0.247806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  36.9 
 
 
414 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  43.89 
 
 
408 aa  84  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  44.44 
 
 
401 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  42.41 
 
 
411 aa  84  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 
404 aa  84  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  41.88 
 
 
411 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  41.88 
 
 
411 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2018  major facilitator transporter  50.34 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3293  hypothetical protein  50.34 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.791308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  38.54 
 
 
419 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  50.54 
 
 
401 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  51.09 
 
 
416 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
405 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  67.61 
 
 
411 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  41.07 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  40.71 
 
 
404 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  72.06 
 
 
403 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  50 
 
 
393 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  34.66 
 
 
402 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  35.9 
 
 
416 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  29.67 
 
 
399 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  37.5 
 
 
399 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  69.12 
 
 
400 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  36.61 
 
 
399 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  43.24 
 
 
385 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1490  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 
415 aa  62.8  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.270736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  49.41 
 
 
399 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  49.41 
 
 
399 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  49.41 
 
 
399 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  43.24 
 
 
399 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  40.7 
 
 
398 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  47.83 
 
 
419 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  40.96 
 
 
406 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  41.48 
 
 
402 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  47.83 
 
 
419 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  41.38 
 
 
398 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  40.38 
 
 
398 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.79 
 
 
394 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  49.46 
 
 
399 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  39.22 
 
 
401 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  36.61 
 
 
393 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  35.65 
 
 
396 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  39.78 
 
 
404 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  52.38 
 
 
400 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1709  major facilitator transporter  37.8 
 
 
404 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  45.24 
 
 
399 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  41.35 
 
 
395 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 
397 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 
388 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
415 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  36.36 
 
 
383 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40 
 
 
400 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  48.53 
 
 
405 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40 
 
 
400 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40 
 
 
400 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6915  major facilitator transporter  40.86 
 
 
401 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.63 
 
 
404 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  48.53 
 
 
405 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  48.53 
 
 
405 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  48.53 
 
 
405 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.11 
 
 
411 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  47.06 
 
 
402 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  48.53 
 
 
405 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  48.53 
 
 
405 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1453  major facilitator transporter  39.78 
 
 
401 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6375  major facilitator transporter  39.78 
 
 
401 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  35.79 
 
 
421 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  39.53 
 
 
403 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  49.02 
 
 
403 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  46.27 
 
 
389 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  36.25 
 
 
389 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  36.25 
 
 
389 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  37.78 
 
 
389 aa  47.4  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  45.83 
 
 
399 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  45.83 
 
 
399 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  42.42 
 
 
422 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 
408 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  42.31 
 
 
394 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 
394 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3309  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
418 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  44.29 
 
 
415 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 
394 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  41.59 
 
 
408 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>