More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3309 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3309  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 418 aa  780    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 399 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 394 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 403 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 399 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  36.08 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  36.08 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  36.08 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  36.08 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  38.7 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 397 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  37.4 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  37.4 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3576  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 		 401 aa  199  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.0569566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 426 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  36.67 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  36.67 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  36.67 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  36.67 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  36.92 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  40 
 
 		 415 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  35.2 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 401 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.89 
 
 		 404 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 404 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 390 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  36.67 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 421 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  35.7 
 
 		 416 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  37 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 415 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 411 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  35.52 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  35.82 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  36.27 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  34.13 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  36.27 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  36.27 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  36.27 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  36.02 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  36.27 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  33.93 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  33.93 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  36.78 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  36.94 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  36.94 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  36.22 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  36.94 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  36.94 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  36.94 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  37.2 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>