More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2929 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  92.89 
 
 
394 aa  670    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  92.89 
 
 
394 aa  670    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  88.32 
 
 
394 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  92.89 
 
 
394 aa  670    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  99.75 
 
 
394 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  99.49 
 
 
394 aa  760    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  92.64 
 
 
394 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  92.64 
 
 
394 aa  670    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  98.98 
 
 
394 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  99.75 
 
 
394 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  92.64 
 
 
394 aa  669    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  100 
 
 
394 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  92.33 
 
 
329 aa  531  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  75.13 
 
 
399 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  75.13 
 
 
399 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  72.46 
 
 
406 aa  528  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  74.74 
 
 
406 aa  528  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  74.87 
 
 
399 aa  531  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  75.26 
 
 
399 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  92.49 
 
 
293 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  71.94 
 
 
399 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  70.57 
 
 
399 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  58.15 
 
 
413 aa  344  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  59.27 
 
 
395 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  49.07 
 
 
411 aa  332  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  59.02 
 
 
397 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  58.23 
 
 
395 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  46.05 
 
 
426 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  45.19 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  44.94 
 
 
399 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  45.7 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  45.71 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  44.68 
 
 
399 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  41.64 
 
 
394 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1850  major facilitator superfamily MFS_1  60.11 
 
 
395 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  49.21 
 
 
416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  46.91 
 
 
421 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  45.24 
 
 
402 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  41.51 
 
 
401 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  47.68 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  44.91 
 
 
399 aa  265  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  43.33 
 
 
410 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  40.53 
 
 
401 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.93 
 
 
383 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  42.97 
 
 
401 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  44.89 
 
 
405 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  44.89 
 
 
399 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  44.89 
 
 
399 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  44.89 
 
 
399 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  44.89 
 
 
399 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  44.89 
 
 
399 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  44.89 
 
 
399 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  40.26 
 
 
401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
402 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 
404 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  41.64 
 
 
399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  47.4 
 
 
408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  44 
 
 
399 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  43.54 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  42.46 
 
 
404 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  44.1 
 
 
416 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  40.62 
 
 
393 aa  250  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  40.45 
 
 
398 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  44.71 
 
 
414 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  39.02 
 
 
403 aa  246  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  42.47 
 
 
419 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  42.5 
 
 
405 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
403 aa  242  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  40.36 
 
 
409 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  43.29 
 
 
399 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  40.82 
 
 
411 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 
422 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  41.35 
 
 
403 aa  239  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 
405 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  41.98 
 
 
399 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  42.78 
 
 
399 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  41.18 
 
 
398 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  41.18 
 
 
398 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  41.18 
 
 
429 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  41.43 
 
 
398 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  41.18 
 
 
398 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  41.18 
 
 
429 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  41.18 
 
 
398 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.55 
 
 
405 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.55 
 
 
405 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  42.64 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  42.64 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  43.13 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.55 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  42.36 
 
 
407 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  39.48 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  39.48 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 
428 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 
391 aa  233  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  37.93 
 
 
389 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  37.93 
 
 
389 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  39.22 
 
 
411 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  39.9 
 
 
405 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  41.84 
 
 
399 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>