More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2415 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  794    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  79.04 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  66.4 
 
 		 405 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  61.36 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  62.78 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  60.38 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  58.49 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  54.03 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  54.23 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  56.84 
 
 		 396 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  60.99 
 
 		 408 aa  341  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  52.34 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  49.04 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  49.04 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  51.4 
 
 		 404 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  51.05 
 
 		 399 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  51.04 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  51.6 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  51.6 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  51.6 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  51.6 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  51.6 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  51.2 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  50.41 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  51.33 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 		 394 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  50.8 
 
 		 399 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  50.8 
 
 		 399 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  51.6 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 391 aa  270  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  51.06 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  52.26 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  46.86 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 406 aa  255  9e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 399 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 403 aa  246  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 		 410 aa  243  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  45.53 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  44.38 
 
 		 402 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  44.53 
 
 		 406 aa  240  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 419 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  44.2 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  44.2 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  47.93 
 
 		 410 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  44.2 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  43.84 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  48.76 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  44.63 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  43.94 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  49.04 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  49.04 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  40.11 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  40.11 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  54.52 
 
 		 420 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  41.33 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  44.2 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 426 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 405 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 403 aa  226  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 		 389 aa  226  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  39.95 
 
 		 396 aa  226  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 405 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 405 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 405 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  47.81 
 
 		 410 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40.65 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  47.81 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40.65 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40.65 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>