More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4811 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  99.02 
 
 		 410 aa  755    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  761    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  91.95 
 
 		 410 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  92.48 
 
 		 412 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  92.48 
 
 		 412 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  92.48 
 
 		 412 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3317  major facilitator transporter  91 
 
 		 411 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.209632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  64.34 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  65.56 
 
 		 403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  67.37 
 
 		 405 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4753  major facilitator superfamily MFS_1  74.31 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  68.24 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  56.19 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2534  major facilitator superfamily transporter  64 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  49.15 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1580  major facilitator superfamily MFS_1  58.2 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  49.03 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  45.79 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 400 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  47.07 
 
 		 389 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  49.48 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  49.73 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  44.86 
 
 		 406 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  44.86 
 
 		 406 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  51.1 
 
 		 429 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  51.1 
 
 		 398 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  51.1 
 
 		 398 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  51.1 
 
 		 398 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  51.1 
 
 		 398 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  51.1 
 
 		 398 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 		 415 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  47.84 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  50.27 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05543  hypothetical protein  44.78 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  50.54 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  45.26 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  50 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  50 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  50.54 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  47.61 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  47.89 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  50.27 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  49.3 
 
 		 403 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  41.49 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  41.49 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  42.04 
 
 		 400 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 447 aa  229  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  36.15 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  36.15 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  48.51 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  47.53 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  43.89 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 405 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 405 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  39.43 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  40.79 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  35.92 
 
 		 415 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  39.63 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 389 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  39.63 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 413 aa  209  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  39.63 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  39.63 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 394 aa  207  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>