More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6119 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  828    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  54.66 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 389 aa  344  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  39.54 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 399 aa  233  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  37.01 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  37.01 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 429 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  35.99 
 
 		 411 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  38.9 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  38.9 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  38.9 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 407 aa  212  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.36 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 410 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 399 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 403 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  38.36 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  38.36 
 
 		 394 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  38.36 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  38.36 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  38.36 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  39.89 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  38.24 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  35.03 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  33.83 
 
 		 403 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  36.78 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  36.78 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  36.78 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  36.78 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  36.78 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  36.78 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  36.78 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  33.66 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  33.66 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.84 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 398 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  33.85 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1933  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 408 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 395 aa  186  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 399 aa  186  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>