More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5193 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
394 aa  733    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  99.24 
 
 
394 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  95.17 
 
 
394 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  74.4 
 
 
391 aa  501  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  67.97 
 
 
403 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  66.93 
 
 
407 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  52.67 
 
 
399 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  49.49 
 
 
404 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  50.66 
 
 
400 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 
399 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  53.08 
 
 
429 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  53.08 
 
 
429 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  53.08 
 
 
398 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  53.08 
 
 
398 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  53.08 
 
 
398 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  52.82 
 
 
398 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  53.08 
 
 
398 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  47.51 
 
 
405 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  47.62 
 
 
415 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  53.46 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  46.49 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  53.63 
 
 
399 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  53.63 
 
 
399 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  52.14 
 
 
399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  52.14 
 
 
399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  51.87 
 
 
399 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.06 
 
 
394 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  44.65 
 
 
383 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  46.69 
 
 
389 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  50.42 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 
397 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  43.23 
 
 
399 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  43.75 
 
 
399 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  43.23 
 
 
399 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  43.85 
 
 
385 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  51.73 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  45.05 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  51.47 
 
 
398 aa  252  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  46.47 
 
 
415 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  40.85 
 
 
403 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  49.32 
 
 
408 aa  242  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 
419 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  43.84 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  46.9 
 
 
403 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  46.45 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  46.81 
 
 
410 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 
406 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 
406 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 
389 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.92 
 
 
399 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.92 
 
 
399 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.92 
 
 
399 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  42.02 
 
 
401 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  46.81 
 
 
412 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  46.65 
 
 
403 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  41.32 
 
 
407 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
403 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  46.81 
 
 
412 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  46.81 
 
 
412 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 
420 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  47.12 
 
 
402 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  38.27 
 
 
393 aa  224  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 
389 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
447 aa  222  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 
410 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  47.92 
 
 
410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  40.37 
 
 
405 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  40.37 
 
 
405 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  40.37 
 
 
405 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  38.92 
 
 
394 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  38.92 
 
 
394 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.92 
 
 
394 aa  219  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  40 
 
 
405 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  47.65 
 
 
410 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  38.92 
 
 
394 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  38.92 
 
 
394 aa  219  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  40.55 
 
 
405 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  44.29 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  39.69 
 
 
394 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  47.61 
 
 
402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  46.74 
 
 
405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  47.61 
 
 
402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  37.99 
 
 
415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  39.53 
 
 
394 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  39.53 
 
 
394 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  39.53 
 
 
394 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  38.92 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  39.53 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  43.98 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  37.89 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  43.57 
 
 
405 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  43.83 
 
 
399 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  43.57 
 
 
399 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  43.57 
 
 
399 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  43.57 
 
 
399 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  43.31 
 
 
399 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  43.57 
 
 
399 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  38.75 
 
 
404 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3317  major facilitator transporter  47.37 
 
 
411 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.209632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>