More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1982 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  99.5 
 
 		 400 aa  770    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  100 
 
 		 400 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  99.75 
 
 		 400 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  70.37 
 
 		 405 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  71.83 
 
 		 405 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  71.03 
 
 		 404 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  70.66 
 
 		 404 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  71.47 
 
 		 405 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  71.47 
 
 		 405 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  71.2 
 
 		 405 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  72.98 
 
 		 405 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  64.83 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  71.27 
 
 		 388 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  62.93 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  63.56 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  59.65 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  59 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  59.4 
 
 		 399 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  60.84 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  61.44 
 
 		 402 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  58.53 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  58.82 
 
 		 399 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 393 aa  349  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  48.06 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  45.81 
 
 		 389 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  45.81 
 
 		 389 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  46.65 
 
 		 396 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  46.92 
 
 		 398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  46.74 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  45.99 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  47.24 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  44.11 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  47.12 
 
 		 402 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 399 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  47.35 
 
 		 408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  42.7 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  37.23 
 
 		 406 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  37.23 
 
 		 406 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  37.23 
 
 		 403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  38.11 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 		 413 aa  239  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  41.31 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  39.89 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 403 aa  219  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 415 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 431 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  40.82 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2698  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 391 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  41.74 
 
 		 405 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  41.81 
 
 		 399 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  41.53 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  41.53 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  41.53 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  41.53 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  41.53 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  41.24 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 413 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  37.86 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  37.86 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  37.86 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  40.11 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  37.34 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  37.6 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 403 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>