More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0275 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  793    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  61.24 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  62.43 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  60.96 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  58.08 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  58.08 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  58.08 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  57.25 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  57.5 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  57.5 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  57.5 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  57.5 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  60.05 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  64.01 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  57.75 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  57.97 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  57.61 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  57.61 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  57.61 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  57.76 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  57.36 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  64.55 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  64.55 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  58.81 
 
 		 399 aa  362  8e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1850  major facilitator superfamily MFS_1  65.57 
 
 		 395 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  57.98 
 
 		 329 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  51.1 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  46.36 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 385 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  46.1 
 
 		 401 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  49.1 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  57.09 
 
 		 293 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  46.74 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 401 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  45.55 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 383 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  48.68 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  46.58 
 
 		 401 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 402 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  46.61 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  44.16 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  50.81 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  44.95 
 
 		 414 aa  255  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  43.51 
 
 		 416 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  43.73 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  44.59 
 
 		 415 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3576  major facilitator superfamily MFS_1  49.08 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.0569566 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  43.64 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  43.64 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  43.64 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  43.64 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  43.64 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  43.64 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 407 aa  246  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 		 405 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  42 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 		 415 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 405 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  45.03 
 
 		 397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 407 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  35.75 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  35.75 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  43.47 
 
 		 401 aa  229  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40.81 
 
 		 400 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40.81 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 411 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40.81 
 
 		 400 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3309  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 		 418 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  47.48 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 403 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 409 aa  225  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>