More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4363 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  753    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  73.16 
 
 		 405 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  62.19 
 
 		 419 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  66.12 
 
 		 410 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  66.39 
 
 		 412 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  66.39 
 
 		 412 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  60.67 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3317  major facilitator transporter  68.6 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.209632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 410 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4753  major facilitator superfamily MFS_1  70.47 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2534  major facilitator superfamily transporter  74.01 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  66.39 
 
 		 410 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  65.56 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 415 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_003296  RS05543  hypothetical protein  46.35 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  47.29 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 		 406 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 		 406 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1580  major facilitator superfamily MFS_1  58.05 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  44.35 
 
 		 415 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 405 aa  256  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  47.31 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  48.69 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  46.37 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  46.98 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  45.72 
 
 		 394 aa  245  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 		 408 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  47.61 
 
 		 399 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  45.72 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  46.39 
 
 		 399 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  41.79 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 399 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  47.58 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  45.76 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 		 396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  45.5 
 
 		 398 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  48.58 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  38.26 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 399 aa  216  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  39.9 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  40.54 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 413 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 391 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  36.54 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  36.54 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  37.8 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  43.05 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  35.68 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  37.8 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  37.8 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.6 
 
 		 411 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  37.98 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  42.19 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  37.98 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 399 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  37.98 
 
 		 394 aa  196  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 394 aa  196  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  37.98 
 
 		 394 aa  196  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>