More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0638 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 387 aa  770    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  60.21 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  55.56 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  41.57 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  38.73 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  38.73 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  38.73 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  42.98 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  38.99 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 405 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 413 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 406 aa  236  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 405 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 399 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  41.74 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  41 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  36.31 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 385 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 399 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  40.06 
 
 		 402 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  35.92 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  35.92 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 395 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  40.11 
 
 		 398 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 421 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.94 
 
 		 404 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 389 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  36.17 
 
 		 415 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 399 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  37.14 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  40.44 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  40.44 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  40.44 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  40.44 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  40.44 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  40.44 
 
 		 429 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  40.44 
 
 		 429 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  37.2 
 
 		 394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 415 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  37.47 
 
 		 394 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  37.2 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  38.06 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  38.06 
 
 		 400 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  37.2 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  38.06 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  41.86 
 
 		 389 aa  213  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 399 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  40.72 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 401 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  37.12 
 
 		 401 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 426 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 394 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1933  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 391 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 401 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>